RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563857.1

RNPS1-208, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene RNPS1, Length 739 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-208ENST00000563857 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RNPS1-208ENST00000563857 CRY2Q49AN0 593 aa20.61■□□□□ 0.89
RNPS1-208ENST00000563857 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RNPS1-208ENST00000563857 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RNPS1-208ENST00000563857 LMNB1P20700 586 aa20.6■□□□□ 0.89
RNPS1-208ENST00000563857 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
RNPS1-208ENST00000563857 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.6■□□□□ 0.89
RNPS1-208ENST00000563857 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.6■□□□□ 0.89
RNPS1-208ENST00000563857 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
RNPS1-208ENST00000563857 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.59■□□□□ 0.89
RNPS1-208ENST00000563857 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.59■□□□□ 0.89
RNPS1-208ENST00000563857 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.59■□□□□ 0.89
RNPS1-208ENST00000563857 TSPYL6Q8N831 410 aa20.59■□□□□ 0.89
RNPS1-208ENST00000563857 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.59■□□□□ 0.89
RNPS1-208ENST00000563857 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.59■□□□□ 0.89
RNPS1-208ENST00000563857 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
RNPS1-208ENST00000563857 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.58■□□□□ 0.89
RNPS1-208ENST00000563857 C21orf2O43822 256 aa20.58■□□□□ 0.89
RNPS1-208ENST00000563857 CCDC93Q567U6 631 aa20.58■□□□□ 0.89
RNPS1-208ENST00000563857 RNF181Q9P0P0 153 aa20.58■□□□□ 0.89
RNPS1-208ENST00000563857 E9PSI1 815 aa20.57■□□□□ 0.88
RNPS1-208ENST00000563857 SLC4A2P04920 1241 aa20.57■□□□□ 0.88
RNPS1-208ENST00000563857 KSR2Q6VAB6 950 aa20.57■□□□□ 0.88
RNPS1-208ENST00000563857 CCDC191Q8NCU4 936 aa20.57■□□□□ 0.88
RNPS1-208ENST00000563857 ADCY9O60503 1353 aa20.57■□□□□ 0.88
RNPS1-208ENST00000563857 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.56■□□□□ 0.88
RNPS1-208ENST00000563857 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
RNPS1-208ENST00000563857 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.56■□□□□ 0.88
RNPS1-208ENST00000563857 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
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RNPS1-208ENST00000563857 VAMP4O75379 141 aa20.55■□□□□ 0.88
RNPS1-208ENST00000563857 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
RNPS1-208ENST00000563857 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-208ENST00000563857 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-208ENST00000563857 TMC4Q7Z404 712 aa20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF428Q96B54 188 aa20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-208ENST00000563857 ABCC12Q96J65 1359 aa20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF521Q96K83 1311 aa20.53■□□□□ 0.88
RNPS1-208ENST00000563857 BBOX1O75936 387 aa20.53■□□□□ 0.88
RNPS1-208ENST00000563857 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
RNPS1-208ENST00000563857 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
RNPS1-208ENST00000563857 CACNA1FO60840 1977 aa20.53■□□□□ 0.88
RNPS1-208ENST00000563857 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-208ENST00000563857 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-208ENST00000563857 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-208ENST00000563857 MYD88Q99836 296 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-208ENST00000563857 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 PI4KAP2A4QPH2 592 aa20.51■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 FLIIQ13045 1269 aa20.51■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa20.51■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.51■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.51■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 NFKBIEO00221 500 aa20.5■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 RASSF7Q02833 373 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 FAM89AQ96GI7 184 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 PSMD1Q99460 953 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 VPS33BQ9H267 617 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 SLX4Q8IY92 1834 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 SLFN5Q08AF3 891 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 GRAPQ13588 217 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 PDE8AO60658 829 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 SP8Q8IXZ3 490 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 DNAAF4Q8WXU2 420 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-208ENST00000563857 GLTPD2A6NH11 291 aa20.45■□□□□ 0.86
RNPS1-208ENST00000563857 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.45■□□□□ 0.86
RNPS1-208ENST00000563857 LINS1Q8NG48 757 aa20.45■□□□□ 0.86
RNPS1-208ENST00000563857 JDP2Q8WYK2 163 aa20.45■□□□□ 0.86
RNPS1-208ENST00000563857 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.45■□□□□ 0.86
RNPS1-208ENST00000563857 SBF1O95248 1867 aa20.45■□□□□ 0.86
RNPS1-208ENST00000563857 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.44■□□□□ 0.86
RNPS1-208ENST00000563857 MIER1Q8N108 512 aa20.44■□□□□ 0.86
RNPS1-208ENST00000563857 SYNE4Q8N205 404 aa20.44■□□□□ 0.86
RNPS1-208ENST00000563857 ABCC4O15439 1325 aa20.44■□□□□ 0.86
RNPS1-208ENST00000563857 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
RNPS1-208ENST00000563857 IFFO2Q5TF58 517 aa20.43■□□□□ 0.86
RNPS1-208ENST00000563857 G2E3Q7L622 706 aa20.43■□□□□ 0.86
RNPS1-208ENST00000563857 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.42■□□□□ 0.86
RNPS1-208ENST00000563857 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
RNPS1-208ENST00000563857 C1QTNF8P60827 252 aa20.42■□□□□ 0.86
RNPS1-208ENST00000563857 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.42■□□□□ 0.86
RNPS1-208ENST00000563857 CACNA1SQ13698 1873 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-208ENST00000563857 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-208ENST00000563857 MPNDQ8N594 471 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-208ENST00000563857 IGKV5-2P06315 115 aa20.4■□□□□ 0.86
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