RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542238.5

RTN3-211, Transcript of reticulon 3, humanhuman

TSL 3

Gene RTN3, Length 735 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3-211ENST00000542238 NFE2L2Q16236 605 aa20.38■□□□□ 0.85
RTN3-211ENST00000542238 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.38■□□□□ 0.85
RTN3-211ENST00000542238 AIDAQ96BJ3 306 aa20.38■□□□□ 0.85
RTN3-211ENST00000542238 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.38■□□□□ 0.85
RTN3-211ENST00000542238 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa20.38■□□□□ 0.85
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RTN3-211ENST00000542238 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.37■□□□□ 0.85
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RTN3-211ENST00000542238 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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RTN3-211ENST00000542238 COL4A5P29400 1685 aa20.3■□□□□ 0.84
RTN3-211ENST00000542238 NIM1KQ8IY84 436 aa20.3■□□□□ 0.84
RTN3-211ENST00000542238 WBP1LQ9NX94 342 aa20.3■□□□□ 0.84
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RTN3-211ENST00000542238 PPIP5K2O43314 1243 aa20.28■□□□□ 0.84
RTN3-211ENST00000542238 EPS15P42566 896 aa20.28■□□□□ 0.84
RTN3-211ENST00000542238 VPS33BQ9H267 617 aa20.28■□□□□ 0.84
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RTN3-211ENST00000542238 PDIA6Q15084 440 aa20.25■□□□□ 0.83
RTN3-211ENST00000542238 AOC3Q16853 763 aa20.25■□□□□ 0.83
RTN3-211ENST00000542238 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.25■□□□□ 0.83
RTN3-211ENST00000542238 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.25■□□□□ 0.83
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RTN3-211ENST00000542238 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.24■□□□□ 0.83
RTN3-211ENST00000542238 BBOX1O75936 387 aa20.23■□□□□ 0.83
RTN3-211ENST00000542238 ECE1P42892 770 aa20.23■□□□□ 0.83
RTN3-211ENST00000542238 SLC51AQ86UW1 340 aa20.23■□□□□ 0.83
RTN3-211ENST00000542238 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
RTN3-211ENST00000542238 ZNRF3Q9ULT6 936 aa20.23■□□□□ 0.83
RTN3-211ENST00000542238 LAMB2P55268 1798 aa20.23■□□□□ 0.83
RTN3-211ENST00000542238 ABCC4O15439 1325 aa20.23■□□□□ 0.83
RTN3-211ENST00000542238 ANXA1P04083 346 aa20.22■□□□□ 0.83
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RTN3-211ENST00000542238 PROSER3Q2NL68 480 aa20.22■□□□□ 0.83
RTN3-211ENST00000542238 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
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RTN3-211ENST00000542238 GPRC5DQ9NZD1 345 aa20.22■□□□□ 0.83
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RTN3-211ENST00000542238 MPNDQ8N594 471 aa20.21■□□□□ 0.83
RTN3-211ENST00000542238 CAPNS2Q96L46 248 aa20.21■□□□□ 0.83
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RTN3-211ENST00000542238 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
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RTN3-211ENST00000542238 NLRP10Q86W26 655 aa20.2■□□□□ 0.82
RTN3-211ENST00000542238 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.2■□□□□ 0.82
RTN3-211ENST00000542238 NECTIN2Q92692 538 aa20.2■□□□□ 0.82
RTN3-211ENST00000542238 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
RTN3-211ENST00000542238 TRAF5O00463 557 aa20.19■□□□□ 0.82
RTN3-211ENST00000542238 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
RTN3-211ENST00000542238 GRM1Q13255 1194 aa20.19■□□□□ 0.82
RTN3-211ENST00000542238 RALBP1Q15311 655 aa20.19■□□□□ 0.82
RTN3-211ENST00000542238 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.19■□□□□ 0.82
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