RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 SLC10A5Q5PT55 438 aa31.13■■■□□ 2.57
PITX3-202ENST00000539804 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
PITX3-202ENST00000539804 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
PITX3-202ENST00000539804 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
PITX3-202ENST00000539804 TSPYL6Q8N831 410 aa31.12■■■□□ 2.57
PITX3-202ENST00000539804 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
PITX3-202ENST00000539804 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
PITX3-202ENST00000539804 SH3TC1Q8TE82 1336 aa31.12■■■□□ 2.57
PITX3-202ENST00000539804 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
PITX3-202ENST00000539804 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa31.11■■■□□ 2.57
PITX3-202ENST00000539804 LMNB1P20700 586 aa31.11■■■□□ 2.57
PITX3-202ENST00000539804 GRIPAP1Q4V328 841 aa31.11■■■□□ 2.57
PITX3-202ENST00000539804 C21orf2O43822 256 aa31.1■■■□□ 2.57
PITX3-202ENST00000539804 C9orf131Q5VYM1 1079 aa31.1■■■□□ 2.57
PITX3-202ENST00000539804 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
PITX3-202ENST00000539804 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
PITX3-202ENST00000539804 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa31.1■■■□□ 2.57
PITX3-202ENST00000539804 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa31.09■■■□□ 2.57
PITX3-202ENST00000539804 ISCA1Q9BUE6 129 aa31.09■■■□□ 2.57
PITX3-202ENST00000539804 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP31.09■■■□□ 2.57
PITX3-202ENST00000539804 ABCC12Q96J65 1359 aa31.08■■■□□ 2.57
PITX3-202ENST00000539804 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
PITX3-202ENST00000539804 CCDC93Q567U6 631 aa31.08■■■□□ 2.57
PITX3-202ENST00000539804 RNF181Q9P0P0 153 aa31.08■■■□□ 2.57
PITX3-202ENST00000539804 LTBP3Q9NS15 1303 aa31.07■■■□□ 2.56
PITX3-202ENST00000539804 RTKN2Q8IZC4 609 aa31.07■■■□□ 2.56
PITX3-202ENST00000539804 CRAMP1Q96RY5 1269 aa31.07■■■□□ 2.56
PITX3-202ENST00000539804 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
PITX3-202ENST00000539804 NEXNQ0ZGT2 675 aa31.06■■■□□ 2.56
PITX3-202ENST00000539804 TAOK3Q9H2K8 898 aa31.06■■■□□ 2.56
PITX3-202ENST00000539804 SLC4A2P04920 1241 aa31.05■■■□□ 2.56
PITX3-202ENST00000539804 ZNF521Q96K83 1311 aa31.04■■■□□ 2.56
PITX3-202ENST00000539804 E9PSI1 815 aa31.04■■■□□ 2.56
PITX3-202ENST00000539804 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
PITX3-202ENST00000539804 KSR2Q6VAB6 950 aa31.04■■■□□ 2.56
PITX3-202ENST00000539804 CCDC191Q8NCU4 936 aa31.04■■■□□ 2.56
PITX3-202ENST00000539804 CACNA1FO60840 1977 aa31.03■■■□□ 2.56
PITX3-202ENST00000539804 VAMP4O75379 141 aa31.03■■■□□ 2.56
PITX3-202ENST00000539804 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
PITX3-202ENST00000539804 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
PITX3-202ENST00000539804 KDM2BQ8NHM5 1336 aa31.01■■■□□ 2.56
PITX3-202ENST00000539804 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa31.01■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 SLX4Q8IY92 1834 aa31.01■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 C7orf43Q8WVR3 580 aa31■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 MYD88Q99836 296 aa31■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 NFKBIEO00221 500 aa30.99■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 RASSF7Q02833 373 aa30.99■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa30.99■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 TMC4Q7Z404 712 aa30.98■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 SBF1O95248 1867 aa30.97■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 PI4KAP2A4QPH2 592 aa30.97■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 BBOX1O75936 387 aa30.97■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP30.97■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 FLIIQ13045 1269 aa30.97■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa30.97■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 ZNF428Q96B54 188 aa30.97■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 CACNA1SQ13698 1873 aa30.97■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa30.97■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 DPY19L2Q6NUT2 758 aa30.95■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 FAM89AQ96GI7 184 aa30.95■■■□□ 2.55
PITX3-202ENST00000539804 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
PITX3-202ENST00000539804 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
PITX3-202ENST00000539804 PSMD1Q99460 953 aa30.94■■■□□ 2.54
PITX3-202ENST00000539804 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
PITX3-202ENST00000539804 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
PITX3-202ENST00000539804 GRAPQ13588 217 aa30.9■■■□□ 2.54
PITX3-202ENST00000539804 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
PITX3-202ENST00000539804 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa30.9■■■□□ 2.54
PITX3-202ENST00000539804 ABCC4O15439 1325 aa30.9■■■□□ 2.54
PITX3-202ENST00000539804 SLFN5Q08AF3 891 aa30.89■■■□□ 2.54
PITX3-202ENST00000539804 SUPT20HQ8NEM7 779 aa30.89■■■□□ 2.54
PITX3-202ENST00000539804 DNAAF4Q8WXU2 420 aa30.89■■■□□ 2.54
PITX3-202ENST00000539804 VPS33BQ9H267 617 aa30.89■■■□□ 2.54
PITX3-202ENST00000539804 GLTPD2A6NH11 291 aa30.88■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 C3orf67Q6ZVT6 689 aa30.88■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 CDHR2Q9BYE9 1310 aa30.88■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 PDE8AO60658 829 aa30.87■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 CCDC152Q4G0S7 254 aa30.87■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 G2E3Q7L622 706 aa30.87■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 SP8Q8IXZ3 490 aa30.87■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 SYNE4Q8N205 404 aa30.87■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 C1QTNF8P60827 252 aa30.86■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 MIER1Q8N108 512 aa30.86■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 LINS1Q8NG48 757 aa30.86■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 LAMB2P55268 1798 aa30.85■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 JDP2Q8WYK2 163 aa30.85■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 NEURL1BA8MQ27 555 aa30.84■■■□□ 2.53
PITX3-202ENST00000539804 IARSP41252 1262 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
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