RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516282.1

RNU6-1146P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1146, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1146P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1146P-201ENST00000516282 KCNA1Q09470 495 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 MBTPS1Q14703 1052 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 PRRT3Q5FWE3 981 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 AEBP1Q8IUX7 1158 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 SEPT3Q9UH03 358 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 SERTAD1Q9UHV2 236 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 A6NJY4 79 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 SMTNP53814 917 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 CENPCQ03188 943 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 CLN3Q13286 438 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 FAM26DQ5JW98 314 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 TBCELQ5QJ74 424 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 CYP2U1Q7Z449 544 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 C7orf43Q8WVR3 580 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 CNKSR1Q969H4 720 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 GRIP2Q9C0E4 1043 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 NDFIP2Q9NV92 336 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 JAG2Q9Y219 1238 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 ATAD2Q6PL18 1390 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1146P-201ENST00000516282 BMP4P12644 408 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 IGFBP4P22692 258 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 SERPINB4P48594 390 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 PSME1Q06323 249 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 WDR44Q5JSH3 913 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 TXNRD3Q86VQ6 643 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 PODXL2Q9NZ53 605 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 EML1O00423 815 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 CDK2AP1O14519 115 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 PRRG2O14669 202 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 F11P03951 625 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 PDE4CQ08493 712 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 SLC9A9Q8IVB4 645 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 STAG2Q8N3U4 1231 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 HINFPQ9BQA5 517 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 SAP130Q9H0E3 1048 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 LRFN2Q9ULH4 789 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 SOWAHDA6NJG2 315 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 NEURL1BA8MQ27 555 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 TNFRSF10BO14763 440 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 BACH1O14867 736 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 FOXO3O43524 673 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 LBRQ14739 615 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 TLR1Q15399 786 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 FCHSD1Q86WN1 690 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 COL26A1Q96A83 441 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 KLF15Q9UIH9 416 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 C9orf172C9J069 976 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 MEN1O00255 615 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 NPR3P17342 541 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 SSTR4P31391 388 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 CTBSQ01459 385 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 MTMR3Q13615 1198 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 TEAD4Q15561 434 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 C4orf17Q53FE4 359 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 ESCO1Q5FWF5 840 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 COX20Q5RI15 118 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 SLC51AQ86UW1 340 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 NBPF15Q8N660 670 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 TP53INP1Q96A56 240 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 MKNK1Q9BUB5 465 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 ZBTB7CA1YPR0 619 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 ICMTO60725 284 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 FGFR3P22607 806 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 NOS2P35228 1153 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 TXLNAP40222 546 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 ARHGAP4P98171 946 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 RGS22Q8NE09 1264 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 MYO19Q96H55 970 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 ANO2Q9NQ90 1003 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 ADGRE2Q9UHX3 823 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 BCS1LQ9Y276 419 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 PARP3Q9Y6F1 533 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 FAM229AH3BQW9 127 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1146P-201ENST00000516282 ZBTB39O15060 712 aa3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms