RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
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SH3BP2-215ENST00000510074 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP2-215ENST00000510074 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP2-215ENST00000510074 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
SH3BP2-215ENST00000510074 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
SH3BP2-215ENST00000510074 BCORQ6W2J9 1755 aa21.12■□□□□ 0.97
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SH3BP2-215ENST00000510074 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.1■□□□□ 0.97
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SH3BP2-215ENST00000510074 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.09■□□□□ 0.97
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SH3BP2-215ENST00000510074 PPIP5K2O43314 1243 aa21.04■□□□□ 0.96
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SH3BP2-215ENST00000510074 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
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SH3BP2-215ENST00000510074 CA12O43570 354 aa20.99■□□□□ 0.95
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SH3BP2-215ENST00000510074 COL4A5P29400 1685 aa20.97■□□□□ 0.95
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SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.97■□□□□ 0.95
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SH3BP2-215ENST00000510074 NTSR2O95665 410 aa20.96■□□□□ 0.95
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SH3BP2-215ENST00000510074 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.96■□□□□ 0.95
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SH3BP2-215ENST00000510074 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
SH3BP2-215ENST00000510074 MCOLN1Q9GZU1 580 aa20.93■□□□□ 0.94
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SH3BP2-215ENST00000510074 NUP98P52948 1817 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP2-215ENST00000510074 RAD17O75943 681 aa20.92■□□□□ 0.94
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SH3BP2-215ENST00000510074 ABCC4O15439 1325 aa20.91■□□□□ 0.94
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