RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 IDH3AP50213 366 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-207ENST00000470201 ARSDP51689 593 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-207ENST00000470201 C8orf34Q49A92 452 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-207ENST00000470201 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-207ENST00000470201 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-207ENST00000470201 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM161BQ96MY7 647 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-207ENST00000470201 SETDB2Q96T68 719 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-207ENST00000470201 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-207ENST00000470201 GNA15P30679 374 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-207ENST00000470201 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-207ENST00000470201 POU4F2Q12837 409 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-207ENST00000470201 ORC1Q13415 861 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF280CQ8ND82 737 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-207ENST00000470201 FRMD6Q96NE9 622 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-207ENST00000470201 USP35Q9P2H5 1018 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-207ENST00000470201 VTI1BQ9UEU0 232 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A1B0GTH6 734 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 A6NHS1 94 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 OPLAHO14841 1288 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 LDLRAD1Q5T700 205 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF19AQ9NV58 838 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 INPP5BP32019 993 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 C6orf118Q5T5N4 469 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 XKR5Q6UX68 686 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 BTLAQ7Z6A9 289 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM87AQ8NBN3 555 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 KLRG1Q96E93 195 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 ZIC5Q96T25 663 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 TTLL8A6PVC2 850 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 EPB42P16452 691 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 MSX1P28360 303 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 SPG7Q9UQ90 795 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 TNFRSF21O75509 655 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 SCARF1Q14162 830 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 CRELD1Q96HD1 420 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 UBAP1LF5GYI3 381 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 RHOQP17081 205 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 FANCCQ00597 558 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 TYRO3Q06418 890 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 CRISPLD1Q9H336 500 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNMB2Q9Y691 235 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 AK5Q9Y6K8 562 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A1W2PNR3 127 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF34Q969K3 372 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 USP20Q9Y2K6 914 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 GJA3Q9Y6H8 435 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-207ENST00000470201 PHACTR2O75167 634 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF76P36508 570 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 NAALADL2Q58DX5 795 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC74AQ96AQ1 378 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 C11orf16Q9NQ32 467 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 GIPC1O14908 333 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 BMP1P13497 986 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 C9orf131Q5VYM1 1079 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 NLRP8Q86W28 1048 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 NT5DC4Q86YG4 428 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 CEP63Q96MT8 703 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 ELP3Q9H9T3 547 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM63CQ9P1W3 806 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 DYRK1BQ9Y463 629 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 XYLBO75191 536 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 EGFRP00533 1210 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 CTSHP09668 335 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.249e-54■■■■■ 28.8
RABGGTB-207ENST00000470201 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM46Q7Z4K8 759 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 PGBD3Q8N328 593 aa7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 122.5 ms