RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.22■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.22■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.21■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.21■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SRGNP10124 158 aa22.21■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TTLL6Q8N841 843 aa22.21■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.21■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYD88Q99836 296 aa22.21■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.21■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STYK1Q6J9G0 422 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MASTLQ96GX5 879 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.19■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CNKSR1Q969H4 720 aa22.19■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF428Q96B54 188 aa22.19■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.19■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NPR1P16066 1061 aa22.18■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CRY2Q49AN0 593 aa22.16■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.16■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.16■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NLRP3Q96P20 1036 aa22.16■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.15■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.15■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.14■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM89AQ96GI7 184 aa22.14■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ALDH1B1P30837 517 aa22.12■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.12■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYNE4Q8N205 404 aa22.12■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.12■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGKV5-2P06315 115 aa22.11■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.11■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.1■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C21orf2O43822 256 aa22.1■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SOGA3Q5TF21 947 aa22.1■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.1■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.1■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.1■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 F6X3S4 739 aa22.09■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LINS1Q8NG48 757 aa22.09■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTPRCP08575 1304 aa22.08■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.08■■□□□ 1.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CACNA1FO60840 1977 aa22.07■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIF3CO14782 793 aa22.06■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HSPA6P17066 643 aa22.06■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GCKRQ14397 625 aa22.06■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.06■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC93Q567U6 631 aa22.05■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BEND3Q5T5X7 828 aa22.05■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.05■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCC4O15439 1325 aa22.05■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDE8AO60658 829 aa22.04■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RASSF7Q02833 373 aa22.04■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.04■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.03■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLX4Q8IY92 1834 aa22.02■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 H7C1W4 665 aa22.02■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NFKBIEO00221 500 aa22.02■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GRAPQ13588 217 aa22.02■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.02■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.02■■□□□ 1.12
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ALDH1L1O75891 902 aa22.01■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
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