RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392991.8

OLFM1-208, Transcript of olfactomedin 1, human

TSL 2 BASIC

Gene OLFM1, Length 1,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
OLFM1-208	ENST00000392991	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	40.8	■■■■■ 4.12
OLFM1-208	ENST00000392991	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		40.8	■■■■■ 4.12
OLFM1-208	ENST00000392991	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	40.8	■■■■■ 4.12
OLFM1-208	ENST00000392991	ADCY9	O60503	1353 aa		40.79	■■■■■ 4.12
OLFM1-208	ENST00000392991	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		40.79	■■■■■ 4.12
OLFM1-208	ENST00000392991	SRGN	P10124	158 aa		40.78	■■■■■ 4.12
OLFM1-208	ENST00000392991	FLII	Q13045	1269 aa		40.78	■■■■■ 4.12
OLFM1-208	ENST00000392991	CACNA1F	O60840	1977 aa		40.77	■■■■■ 4.12
OLFM1-208	ENST00000392991	KSR2	Q6VAB6	950 aa		40.77	■■■■■ 4.12
OLFM1-208	ENST00000392991	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		40.76	■■■■■ 4.12
OLFM1-208	ENST00000392991	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	40.76	■■■■■ 4.12
OLFM1-208	ENST00000392991	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		40.76	■■■■■ 4.12
OLFM1-208	ENST00000392991	ZNF428	Q96B54	188 aa		40.76	■■■■■ 4.12
OLFM1-208	ENST00000392991	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		40.76	■■■■■ 4.12
OLFM1-208	ENST00000392991	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		40.75	■■■■■ 4.11
OLFM1-208	ENST00000392991	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	40.75	■■■■■ 4.11
OLFM1-208	ENST00000392991	MYD88	Q99836	296 aa		40.75	■■■■■ 4.11
OLFM1-208	ENST00000392991	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	40.75	■■■■■ 4.11
OLFM1-208	ENST00000392991	TTLL6	Q8N841	843 aa		40.74	■■■■■ 4.11
OLFM1-208	ENST00000392991	STYK1	Q6J9G0	422 aa		40.73	■■■■■ 4.11
OLFM1-208	ENST00000392991	MASTL	Q96GX5	879 aa		40.73	■■■■■ 4.11
OLFM1-208	ENST00000392991	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	40.73	■■■■■ 4.11
OLFM1-208	ENST00000392991	SYNE4	Q8N205	404 aa		40.72	■■■■■ 4.11
OLFM1-208	ENST00000392991	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		40.71	■■■■■ 4.11
OLFM1-208	ENST00000392991	CRY2	Q49AN0	593 aa		40.7	■■■■■ 4.11
OLFM1-208	ENST00000392991	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		40.7	■■■■■ 4.11
OLFM1-208	ENST00000392991	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		40.69	■■■■■ 4.11
OLFM1-208	ENST00000392991	NPR1	P16066	1061 aa		40.69	■■■■■ 4.1
OLFM1-208	ENST00000392991	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	40.69	■■■■■ 4.1
OLFM1-208	ENST00000392991	CHD4	Q14839	1912 aa		40.69	■■■■■ 4.1
OLFM1-208	ENST00000392991	IGKV5-2	P06315	115 aa		40.66	■■■■■ 4.1
OLFM1-208	ENST00000392991	CNKSR1	Q969H4	720 aa		40.66	■■■■■ 4.1
OLFM1-208	ENST00000392991	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	40.65	■■■■■ 4.1
OLFM1-208	ENST00000392991	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		40.65	■■■■■ 4.1
OLFM1-208	ENST00000392991	FAM89A	Q96GI7	184 aa		40.64	■■■■■ 4.1
OLFM1-208	ENST00000392991	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	40.64	■■■■■ 4.1
OLFM1-208	ENST00000392991	CACNA1S	Q13698	1873 aa		40.64	■■■■■ 4.1
OLFM1-208	ENST00000392991	SLX4	Q8IY92	1834 aa		40.63	■■■■■ 4.1
OLFM1-208	ENST00000392991	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	40.63	■■■■■ 4.09
OLFM1-208	ENST00000392991	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		40.63	■■■■■ 4.09
OLFM1-208	ENST00000392991	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	40.63	■■■■■ 4.09
OLFM1-208	ENST00000392991	LAMB2	P55268	1798 aa		40.63	■■■■■ 4.09
OLFM1-208	ENST00000392991	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		40.62	■■■■■ 4.09
OLFM1-208	ENST00000392991	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		40.62	■■■■■ 4.09
OLFM1-208	ENST00000392991	NLRP3	Q96P20	1036 aa		40.62	■■■■■ 4.09
OLFM1-208	ENST00000392991	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	40.62	■■■■■ 4.09
OLFM1-208	ENST00000392991	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		40.62	■■■■■ 4.09
OLFM1-208	ENST00000392991	YY1	P25490	414 aa		40.61	■■■■■ 4.09
OLFM1-208	ENST00000392991	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		40.6	■■■■■ 4.09
OLFM1-208	ENST00000392991	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	40.59	■■■■■ 4.09
OLFM1-208	ENST00000392991	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	40.59	■■■■■ 4.09
OLFM1-208	ENST00000392991	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	40.59	■■■■■ 4.09
OLFM1-208	ENST00000392991	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	40.59	■■■■■ 4.09
OLFM1-208	ENST00000392991	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	40.59	■■■■■ 4.09
OLFM1-208	ENST00000392991	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	40.58	■■■■■ 4.09
OLFM1-208	ENST00000392991	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		40.57	■■■■■ 4.09
OLFM1-208	ENST00000392991		F6X3S4	739 aa		40.57	■■■■■ 4.09
OLFM1-208	ENST00000392991	C21orf2	O43822	256 aa		40.57	■■■■■ 4.09
OLFM1-208	ENST00000392991	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		40.57	■■■■■ 4.09
OLFM1-208	ENST00000392991	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	40.57	■■■■■ 4.09
OLFM1-208	ENST00000392991	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	40.56	■■■■■ 4.08
OLFM1-208	ENST00000392991	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		40.56	■■■■■ 4.08
OLFM1-208	ENST00000392991	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	40.54	■■■■■ 4.08
OLFM1-208	ENST00000392991	ALDH1B1	P30837	517 aa		40.54	■■■■■ 4.08
OLFM1-208	ENST00000392991	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		40.54	■■■■■ 4.08
OLFM1-208	ENST00000392991	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	40.54	■■■■■ 4.08
OLFM1-208	ENST00000392991	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	40.53	■■■■■ 4.08
OLFM1-208	ENST00000392991	LINS1	Q8NG48	757 aa		40.52	■■■■■ 4.08
OLFM1-208	ENST00000392991	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		40.52	■■■■■ 4.08
OLFM1-208	ENST00000392991	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		40.5	■■■■■ 4.07
OLFM1-208	ENST00000392991	NFKBIE	O00221	500 aa		40.49	■■■■■ 4.07
OLFM1-208	ENST00000392991	RASSF7	Q02833	373 aa		40.49	■■■■■ 4.07
OLFM1-208	ENST00000392991	BEND3	Q5T5X7	828 aa		40.49	■■■■■ 4.07
OLFM1-208	ENST00000392991	GCKR	Q14397	625 aa		40.48	■■■■■ 4.07
OLFM1-208	ENST00000392991	ABCC4	O15439	1325 aa		40.47	■■■■■ 4.07
OLFM1-208	ENST00000392991	PTPRC	P08575	1304 aa		40.47	■■■■■ 4.07
OLFM1-208	ENST00000392991	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		40.47	■■■■■ 4.07
OLFM1-208	ENST00000392991	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	40.47	■■■■■ 4.07
OLFM1-208	ENST00000392991	OLFM4	Q6UX06	510 aa		40.47	■■■■■ 4.07
OLFM1-208	ENST00000392991	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		40.47	■■■■■ 4.07
OLFM1-208	ENST00000392991	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	40.46	■■■■■ 4.07
OLFM1-208	ENST00000392991		H7C1W4	665 aa		40.44	■■■■■ 4.06
OLFM1-208	ENST00000392991	PRELP	P51888	382 aa		40.44	■■■■■ 4.06
OLFM1-208	ENST00000392991	SOGA3	Q5TF21	947 aa		40.44	■■■■■ 4.06
OLFM1-208	ENST00000392991	SLC51A	Q86UW1	340 aa		40.43	■■■■■ 4.06
OLFM1-208	ENST00000392991	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	40.42	■■■■■ 4.06
OLFM1-208	ENST00000392991	CCDC93	Q567U6	631 aa		40.42	■■■■■ 4.06
OLFM1-208	ENST00000392991	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		40.42	■■■■■ 4.06
OLFM1-208	ENST00000392991	SBF1	O95248	1867 aa		40.42	■■■■■ 4.06
OLFM1-208	ENST00000392991	SNED1	Q8TER0	1413 aa		40.42	■■■■■ 4.06
OLFM1-208	ENST00000392991	COL4A1	P02462	1669 aa		40.41	■■■■■ 4.06
OLFM1-208	ENST00000392991	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	40.41	■■■■■ 4.06
OLFM1-208	ENST00000392991	PDE8A	O60658	829 aa		40.41	■■■■■ 4.06
OLFM1-208	ENST00000392991	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	40.41	■■■■■ 4.06
OLFM1-208	ENST00000392991	CASP7	P55210	303 aa		40.41	■■■■■ 4.06
OLFM1-208	ENST00000392991	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		40.41	■■■■■ 4.06
OLFM1-208	ENST00000392991	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	40.41	■■■■■ 4.06
OLFM1-208	ENST00000392991	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		40.4	■■■■■ 4.06
OLFM1-208	ENST00000392991	TAF1	P21675	1872 aa		40.39	■■■■■ 4.06
OLFM1-208	ENST00000392991	GRAP	Q13588	217 aa		40.38	■■■■■ 4.05

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