RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 URI1O94763 535 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 UBA7P41226 1012 aa23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 AMPD3Q01432 767 aa23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL40Q2TBA0 621 aa23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 GRM8O00222 908 aa23.41■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 ANAPC15P60006 121 aa23.41■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 PPP4R3AQ6IN85 833 aa23.41■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.41■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 KANK3Q6NY19 840 aa23.41■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 KSR2Q6VAB6 950 aa23.41■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 BRF1Q92994 677 aa23.41■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 TMX3Q96JJ7 454 aa23.41■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 KAT14Q9H8E8 782 aa23.41■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.41■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23.41■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 YEATS4O95619 227 aa23.4■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 ATP8B2P98198 1209 aa23.4■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.4■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC102BQ68D86 513 aa23.4■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 CALML4Q96GE6 196 aa23.4■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.4■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 USO1O60763 962 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.4■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
CCSAP-203ENST00000366687 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 POLKQ9UBT6 870 aa23.39■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 BIN1O00499 593 aa23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 IDEP14735 1019 aa23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 ATP2B3Q16720 1220 aa23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 SLC26A6Q9BXS9 759 aa23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 TMTC2Q8N394 836 aa23.38■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 EZRP15311 586 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 PAFAH1B1P43034 410 aa23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 MAP9Q49MG5 647 aa23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 ATP10BO94823 1461 aa23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 HLA-DOAP06340 250 aa23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 LINS1Q8NG48 757 aa23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 DNAI2Q9GZS0 605 aa23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 A2MP01023 1474 aa23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.37■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 CETN1Q12798 172 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 CPLX3Q8WVH0 158 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 CABP5Q9NP86 173 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 CASQ1P31415 396 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 UVSSAQ2YD98 709 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 MSH6P52701 1360 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 RFC4P35249 363 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 NBPF4Q96M43 638 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 KRT23Q9C075 422 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 PTPRKQ15262 1439 aa23.36■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 WTAPQ15007 396 aa23.35■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 RRP9O43818 475 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 TNNT1P13805 278 aa23.35■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 MCM3P25205 808 aa23.35■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 PANK2Q9BZ23 570 aa23.35■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 FEZ1Q99689 392 aa23.35■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 SLC39A6Q13433 755 aa23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB43O43298 467 aa23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 BMP15O95972 392 aa23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 STX8Q9UNK0 236 aa23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 NEBLO76041 1014 aa23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 GSTO1P78417 241 aa23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 LUZP1Q86V48 1076 aa23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 SCLT1Q96NL6 688 aa23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 ADCY5O95622 1261 aa23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 ESR2Q92731 530 aa23.34■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 TAF3Q5VWG9 929 aa23.33■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.33■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 FLT4P35916 1363 aa23.33■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 TMC6Q7Z403 805 aa23.33■■□□□ 1.33
CCSAP-203ENST00000366687 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.33■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa23.32■■□□□ 1.32
CCSAP-203ENST00000366687 NECAB1Q8N987 351 aa23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.7 ms