RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330334.7

HDDC3-201, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-201ENST00000330334 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.1■■□□□ 1.29
HDDC3-201ENST00000330334 NECTIN2Q92692 538 aa23.1■■□□□ 1.29
HDDC3-201ENST00000330334 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HDDC3-201ENST00000330334 IFT57Q9NWB7 429 aa23.1■■□□□ 1.29
HDDC3-201ENST00000330334 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.09■■□□□ 1.29
HDDC3-201ENST00000330334 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.09■■□□□ 1.29
HDDC3-201ENST00000330334 CRAMP1Q96RY5 1269 aa23.09■■□□□ 1.29
HDDC3-201ENST00000330334 MBIPQ9NS73 344 aa23.09■■□□□ 1.29
HDDC3-201ENST00000330334 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
HDDC3-201ENST00000330334 GNAI1P63096 354 aa23.08■■□□□ 1.29
HDDC3-201ENST00000330334 TCIRG1Q13488 830 aa23.08■■□□□ 1.29
HDDC3-201ENST00000330334 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
HDDC3-201ENST00000330334 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.08■■□□□ 1.29
HDDC3-201ENST00000330334 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa23.08■■□□□ 1.29
HDDC3-201ENST00000330334 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.07■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.07■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 NLRP3Q96P20 1036 aa23.07■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 POTECB2RU33 542 aa23.06■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 NLRP10Q86W26 655 aa23.06■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 PSMD1Q99460 953 aa23.06■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 HYPKQ9NX55 129 aa23.06■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.05■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.05■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.05■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 OLFM4Q6UX06 510 aa23.04■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.04■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 SNED1Q8TER0 1413 aa23.04■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 WDR90Q96KV7 1748 aa23.03■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 SYNE4Q8N205 404 aa23.03■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 CACNA1SQ13698 1873 aa23.02■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 CCDC27Q2M243 656 aa23.02■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 CCDC184Q52MB2 194 aa23.02■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.02■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.02■■□□□ 1.28
HDDC3-201ENST00000330334 DDNO94850 711 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HDDC3-201ENST00000330334 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
HDDC3-201ENST00000330334 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HDDC3-201ENST00000330334 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
HDDC3-201ENST00000330334 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
HDDC3-201ENST00000330334 ISCA1Q9BUE6 129 aa23■■□□□ 1.27
HDDC3-201ENST00000330334 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23■■□□□ 1.27
HDDC3-201ENST00000330334 FZD9O00144 591 aa22.99■■□□□ 1.27
HDDC3-201ENST00000330334 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
HDDC3-201ENST00000330334 BBOX1O75936 387 aa22.99■■□□□ 1.27
HDDC3-201ENST00000330334 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.98■■□□□ 1.27
HDDC3-201ENST00000330334 ANP32CO43423 234 aa22.98■■□□□ 1.27
HDDC3-201ENST00000330334 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.98■■□□□ 1.27
HDDC3-201ENST00000330334 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
HDDC3-201ENST00000330334 VPS33BQ9H267 617 aa22.97■■□□□ 1.27
HDDC3-201ENST00000330334 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
HDDC3-201ENST00000330334 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.96■■□□□ 1.27
HDDC3-201ENST00000330334 JDP2Q8WYK2 163 aa22.96■■□□□ 1.27
HDDC3-201ENST00000330334 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.96■■□□□ 1.27
HDDC3-201ENST00000330334 ABCC4O15439 1325 aa22.95■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 WWC1Q8IX03 1113 aa22.95■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.94■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 SP8Q8IXZ3 490 aa22.94■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 MRS2Q9HD23 443 aa22.94■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 IL16Q14005 1332 aa22.93■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.93■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 GOLGA2Q08379 1002 aa22.93■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 GPC2Q8N158 579 aa22.93■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.92■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 CHADLQ6NUI6 762 aa22.92■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 TMC4Q7Z404 712 aa22.92■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.92■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 GRAPQ13588 217 aa22.91■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.91■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 FAM89AQ96GI7 184 aa22.91■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.9■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 KLRG1Q96E93 195 aa22.9■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 HACL1Q9UJ83 578 aa22.9■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 SCN4AP35499 1836 aa22.89■■□□□ 1.26
HDDC3-201ENST00000330334 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 LDHDQ86WU2 507 aa22.89■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 TSPYL6Q8N831 410 aa22.89■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 HTRA3P83110 453 aa22.88■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.88■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 SLC51AQ86UW1 340 aa22.87■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 MPNDQ8N594 471 aa22.87■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 JMYQ8N9B5 988 aa22.87■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
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