RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304954.3

CSN3-201, Transcript of casein kappa, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSN3, Length 836 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3-201ENST00000304954 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.55□□□□□ -1.04
CSN3-201ENST00000304954 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CSN3-201ENST00000304954 ANO2Q9NQ90 1003 aa8.55□□□□□ -1.04
CSN3-201ENST00000304954 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.55□□□□□ -1.04
CSN3-201ENST00000304954 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.55□□□□□ -1.04
CSN3-201ENST00000304954 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CSN3-201ENST00000304954 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CSN3-201ENST00000304954 DCDC2BA2VCK2 349 aa8.53□□□□□ -1.04
CSN3-201ENST00000304954 BNIP3LO60238 219 aa8.53□□□□□ -1.04
CSN3-201ENST00000304954 FGFR3P22607 806 aa8.53□□□□□ -1.04
CSN3-201ENST00000304954 PDE3BQ13370 1112 aa8.53□□□□□ -1.04
CSN3-201ENST00000304954 MTMR3Q13615 1198 aa8.53□□□□□ -1.04
CSN3-201ENST00000304954 MX2P20592 715 aa8.52□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 ABHD17AQ96GS6 310 aa8.52□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.52□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 NEFLP07196 543 aa8.51□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 THBS1P07996 1170 aa8.51□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 ERCC3P19447 782 aa8.51□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 MAP2K3P46734 347 aa8.51□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 ARHGAP4P98171 946 aa8.51□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.51□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 MBIPQ9NS73 344 aa8.51□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 OPLAHO14841 1288 aa8.5□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 EGFRP00533 1210 aa8.5□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 CCINQ13939 588 aa8.5□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 CCDC27Q2M243 656 aa8.5□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.5□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 EDEM1Q92611 657 aa8.5□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 PNMA5Q96PV4 448 aa8.5□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 ZBTB39O15060 712 aa8.49□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 BMP4P12644 408 aa8.49□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 VEGFBP49765 207 aa8.49□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 GPR152Q8TDT2 470 aa8.49□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 PRR12Q9ULL5 1215 aa8.49□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 GPR25O00155 361 aa8.48□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 WFS1O76024 890 aa8.48□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 PDGFAP04085 211 aa8.48□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.48□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.48□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.47□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 FZD6O60353 706 aa8.47□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 XYLBO75191 536 aa8.47□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 MAPK1P28482 360 aa8.47□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 SPEM2Q0P670 501 aa8.47□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 PCSK7Q16549 785 aa8.47□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 ECM1Q16610 540 aa8.47□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 XKR5Q6UX68 686 aa8.47□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 KLRG1Q96E93 195 aa8.47□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 POLIQ9UNA4 740 aa8.47□□□□□ -1.05
CSN3-201ENST00000304954 CD33P20138 364 aa8.46□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 NLRP13Q86W25 1043 aa8.46□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 ATCAYQ86WG3 371 aa8.46□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 GJD3Q8N144 294 aa8.46□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 TMC1Q8TDI8 760 aa8.46□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 ARAFP10398 606 aa8.45□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 FAM26DQ5JW98 314 aa8.45□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 PMEPA1Q969W9 287 aa8.45□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 GSX2Q9BZM3 304 aa8.45□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.45□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 FGD1P98174 961 aa8.44□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 C8orf34Q49A92 452 aa8.44□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 TREML4Q6UXN2 200 aa8.44□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 ZNF438Q7Z4V0 828 aa8.44□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 ASB16Q96NS5 453 aa8.44□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 MAP3K6O95382 1288 aa8.43□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 ADH6P28332 368 aa8.43□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 CTBSQ01459 385 aa8.43□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 GAS6Q14393 721 aa8.43□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.43□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 FAM129BQ96TA1 746 aa8.43□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.43□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 ERBB4Q15303 1308 aa8.43□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 SIN3BO75182 1162 aa8.42□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 RARAP10276 462 aa8.42□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 COL19A1Q14993 1142 aa8.42□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 STRN4Q9NRL3 753 aa8.42□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 LRRC4BQ9NT99 713 aa8.42□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 IGF1RP08069 1367 aa8.42□□□□□ -1.06
CSN3-201ENST00000304954 SOX18P35713 384 aa8.41□□□□□ -1.06
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