RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 SASH1O94885 1247 aa20.67■□□□□ 0.9
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PDE4A-201ENST00000293683 KAZALD1Q96I82 304 aa20.67■□□□□ 0.9
PDE4A-201ENST00000293683 TM6SF1Q9BZW5 370 aa20.67■□□□□ 0.9
PDE4A-201ENST00000293683 KCNF1Q9H3M0 494 aa20.67■□□□□ 0.9
PDE4A-201ENST00000293683 A0A0D9SFI3 127 aa20.66■□□□□ 0.9
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PDE4A-201ENST00000293683 LIG1P18858 919 aa20.65■□□□□ 0.9
PDE4A-201ENST00000293683 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.65■□□□□ 0.9
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PDE4A-201ENST00000293683 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.64■□□□□ 0.89
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PDE4A-201ENST00000293683 SPTLC3Q9NUV7 552 aa20.63■□□□□ 0.89
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PDE4A-201ENST00000293683 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
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PDE4A-201ENST00000293683 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
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PDE4A-201ENST00000293683 LMO7Q8WWI1 1683 aa20.59■□□□□ 0.89
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PDE4A-201ENST00000293683 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
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PDE4A-201ENST00000293683 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
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PDE4A-201ENST00000293683 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.58■□□□□ 0.89
PDE4A-201ENST00000293683 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PDE4A-201ENST00000293683 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PDE4A-201ENST00000293683 LINS1Q8NG48 757 aa20.58■□□□□ 0.88
PDE4A-201ENST00000293683 RPS6KB1P23443 525 aa20.57■□□□□ 0.88
PDE4A-201ENST00000293683 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.57■□□□□ 0.88
PDE4A-201ENST00000293683 PTGS1P23219 599 aa20.57■□□□□ 0.88
PDE4A-201ENST00000293683 PSMA5P28066 241 aa20.57■□□□□ 0.88
PDE4A-201ENST00000293683 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.57■□□□□ 0.88
PDE4A-201ENST00000293683 MED23Q9ULK4 1368 aa20.56■□□□□ 0.88
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PDE4A-201ENST00000293683 IGKV5-2P06315 115 aa20.56■□□□□ 0.88
PDE4A-201ENST00000293683 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.56■□□□□ 0.88
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PDE4A-201ENST00000293683 ESCO1Q5FWF5 840 aa20.56■□□□□ 0.88
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PDE4A-201ENST00000293683 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
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PDE4A-201ENST00000293683 COL15A1P39059 1388 aa20.55■□□□□ 0.88
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PDE4A-201ENST00000293683 TNMDQ9H2S6 317 aa20.55■□□□□ 0.88
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PDE4A-201ENST00000293683 ELP1O95163 1332 aa20.55■□□□□ 0.88
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PDE4A-201ENST00000293683 MYL6BP14649 208 aa20.54■□□□□ 0.88
PDE4A-201ENST00000293683 LRMPQ12912 555 aa20.53■□□□□ 0.88
PDE4A-201ENST00000293683 RNF20Q5VTR2 975 aa20.53■□□□□ 0.88
PDE4A-201ENST00000293683 NRBP1Q9UHY1 535 aa20.53■□□□□ 0.88
PDE4A-201ENST00000293683 UTYO14607 1347 aa20.53■□□□□ 0.88
PDE4A-201ENST00000293683 NR1I2O75469 434 aa20.53■□□□□ 0.88
PDE4A-201ENST00000293683 PDCP20941 246 aa20.53■□□□□ 0.88
PDE4A-201ENST00000293683 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
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