RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027592.5

Ubxn4-201, Transcript of UBX domain-containing protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubxn4, Length 4,113 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Trim25Q61510 634 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm21985Q6P6P5 1106 aa16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ptcd1Q8C2E4 695 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tango6Q8C3S2 1079 aa16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Wasf1Q8R5H6 559 aa16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 PzpQ61838 1495 aa16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Mtmr3Q8K296 1196 aa16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 SfswapQ3USH5 945 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 U2af1l4Q8BGJ9 220 aa16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cyp26c1B2RXA7 518 aa16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 EspnlQ3UYR4 1005 aa16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Vps54Q5SPW0 977 aa16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cyp7a1Q64505 503 aa16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Necab1Q8BG18 352 aa16.12■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Stx1aO35526 288 aa16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tmem266Q8BZB3 538 aa16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nat10Q8K224 1024 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 CenpqQ9CPQ5 267 aa16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dhx8A2A4P0 1244 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ppp1r10Q80W00 888 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Trpm2Q91YD4 1506 aa16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ccdc112A0AUP1 442 aa16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Lrrfip2Q91WK0 415 aa16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rufy3Q9D394 469 aa16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nos1Q9Z0J4 1429 aa16.11■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cnksr1A2A9K7 700 aa16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gse1Q3U3C9 1213 aa16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nek11Q8C0Q4 628 aa16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Yeats2Q3TUF7 1407 aa16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Zscan29E9Q5B4 869 aa16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Fam170aQ66LM6 333 aa16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Timm10P62073 90 aa16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cbx1P83917 185 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Pde4dQ01063 747 aa16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Mctp2Q5RJH2 878 aa16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Lmbrd2Q8C561 694 aa16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Kif24Q6NWW5 1356 aa16.1■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 NmiO35309 314 aa16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nap1l1P28656 391 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tyro3P55144 880 aa16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Lrrcc1Q69ZB0 1026 aa16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Disp3A3KFU9 1347 aa16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Metap2O08663 478 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Atp2b3Q0VF55 1220 aa16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Lmbr1Q9JIT0 490 aa16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nup133Q8R0G9 1155 aa16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Klf15Q9EPW2 415 aa16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 SetQ9EQU5 289 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Adgrl1Q80TR1 1466 aa16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Pet2A2AHY8 747 aa16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nucb2P81117 420 aa16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ccdc150Q8CDI7 1110 aa16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rbm19Q8R3C6 952 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cep120Q7TSG1 988 aa16.08■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cfap65Q3V0B4 1847 aa16.08■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dnm1P39053 867 aa16.08■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 DymQ8CHY3 669 aa16.08■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Fam213aQ9CYH2 218 aa16.08■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 DmtnQ9WV69 405 aa16.08■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Slc7a3P70423 618 aa16.08■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ppp4r3aQ6P2K6 820 aa16.08■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Sass6Q80UK7 654 aa16.08■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Abcd1P48410 736 aa16.07■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cnot6lQ8VEG6 555 aa16.07■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Znf704Q9ERQ3 566 aa16.07■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Synj2Q9D2G5 1434 aa16.07■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 CrklP47941 303 aa16.07■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Klc3Q91W40 508 aa16.07■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cfap45Q9D9U9 551 aa16.07■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 ItpripQ3TNL8 555 aa16.07■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Naa30Q8CES0 364 aa16.07■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ppm1fQ8CGA0 452 aa16.07■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ets1P27577 440 aa16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Stim1P70302 685 aa16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cfap157Q0VFX2 523 aa16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cep112Q5PR68 954 aa16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Atg3Q9CPX6 314 aa16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Jakmip2D3YXK0 820 aa16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Speer4dL7N216 212 aa16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Exoc5Q3TPX4 708 aa16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Pank2Q3U4S0 443 aa16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ifit1bl2Q3U687 466 aa16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Fam160b2Q80YR2 744 aa16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Plekho1Q9JIY0 408 aa16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Znf521Q6KAS7 1311 aa16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Lmod1Q8BVA4 595 aa16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Uggt1Q6P5E4 1551 aa16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tlr7P58681 1050 aa16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Znf335A2A5K6 1337 aa16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rufy1Q8BIJ7 712 aa16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rdm1Q9CQK3 281 aa16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Zbtb43Q9DAI4 467 aa16.05■□□□□ 0.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Sil1Q9EPK6 465 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.4 ms