RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373779.7

PTPRU-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-202ENST00000373779 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 CSNK1A1LQ8N752 337 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 MACROD1Q9BQ69 325 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 BABAM2Q9NXR7 383 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 HEPACAM2A8MVW5 462 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 TSPAN12O95859 305 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 FAM198BQ6UWH4 519 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SLC35F2Q8IXU6 374 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 C7orf61Q8IZ16 206 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 MYEOVQ96EZ4 313 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SNX18Q96RF0 628 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 DPYSL5Q9BPU6 564 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 POTEKPQ9BYX7 375 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 A4GALTQ9NPC4 353 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SHROOM3Q8TF72 1996 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 CYB5AP00167 134 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 AHRP35869 848 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 FRKP42685 505 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 ACSM3Q53FZ2 586 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 OR51L1Q8NGJ5 315 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 CASTOR1Q8WTX7 329 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 OR52D1Q9H346 318 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SHC2P98077 582 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SLX4IPQ5VYV7 408 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 OR4N4Q8N0Y3 316 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 HMGCLL1Q8TB92 370 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 MYLIPQ8WY64 445 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 CDS1Q92903 461 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 FAM183AA6NL82 134 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 C11orf98E9PRG8 122 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 MAS1P04201 325 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 PRKCAP17252 672 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 S1PR1P21453 382 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 ALG1LQ6GMV1 187 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 NLRP8Q86W28 1048 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SERINC2Q96SA4 455 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 OR8D2Q9GZM6 311 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 RNF167Q9H6Y7 350 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 CREBZFQ9NS37 354 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 PRH1P02810 166 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SNTA1Q13424 505 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 NEURL3Q96EH8 262 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SIAEQ9HAT2 523 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 FZD3Q9NPG1 666 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 RLIMQ9NVW2 624 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 DHDHQ9UQ10 334 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 NDUFB2O95178 105 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 GKN3PP0CG01 181 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 MASP1P48740 699 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 INAVAQ3KP66 663 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 LEG1Q6P5S2 330 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 DOCK1Q14185 1865 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 METTL11BQ5VVY1 283 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 HACD4Q5VWC8 232 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 CDRT4Q8N9R6 151 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SMARCD2Q92925 531 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 TAS2R3Q9NYW6 316 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 CLEC2DQ9UHP7 191 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 OSGIN1Q9UJX0 560 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 A0A1B0GVC2 190 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 A6NIN4 97 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 C5AR1P21730 350 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 TGFBR1P36897 503 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 CCSMST1Q4G0I0 132 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 LIMS2Q7Z4I7 341 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 ADAM29Q9UKF5 820 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 F11P03951 625 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SLC1A3P43003 542 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 XCR1P46094 333 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP16.37■□□□□ 0.216e-7■■■□□ 14.6
PTPRU-202ENST00000373779 FAM189A2Q15884 450 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 OR52I1Q8NGK6 324 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 C4orf36Q96KX1 117 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 COQ10AQ96MF6 247 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 INPP5EQ9NRR6 644 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 TFP02787 698 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms