RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP-1.87□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa-1.87□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 CSO75390 466 aaKnown RBP-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 GABRB1P18505 474 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 DPP4P27487 766 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 TKTL1P51854 596 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 GALK2Q01415 458 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTGISQ16647 500 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 RFX4Q33E94 735 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC38Q502W7 563 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF542PQ5EBM4 170 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 XKR7Q5GH72 579 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL31Q6EBC2 164 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 ERICH1Q86X53 443 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 RIMKLAQ8IXN7 391 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 PNKDQ8N490 385 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 ESX1Q8N693 406 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR9A1PQ8NGU1 263 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 SELENOMQ8WWX9 145 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 MOB3AQ96BX8 217 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR2A5Q96R48 311 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 OPA3Q9H6K4 179 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNRD1Q9P1U0 126 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 HEG1Q9ULI3 1381 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZBED9Q6R2W3 1325 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABCA2Q9BZC7 2435 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 E5RGE8 158 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 SGK1O00141 431 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 TYROBPO43914 113 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 MITFO75030 526 aaPredicted RBP-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 TADA2AO75478 443 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 PENKP01210 267 aaPredicted RBP-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 SAGP10523 405 aaPredicted RBP-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 TCF4P15884 667 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 VDAC1P21796 283 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 STARP49675 285 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRRX1P54821 245 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 ESRRGP62508 458 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPR50Q13585 617 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACKR1Q16570 336 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 STUMQ69YW2 141 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 SKA3Q8IX90 412 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF679Q8IYX0 411 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR2A12Q8NGT7 310 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 MUC7Q8TAX7 377 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM110BQ8TC76 370 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 C17orf50Q8WW18 174 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAB7BQ96AH8 199 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 VPS33AQ96AX1 596 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCM2Q9BSQ5 444 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 S100A14Q9HCY8 104 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 DEC1Q9P2X7 70 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 NSG2Q9Y328 171 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 UNC79Q9P2D8 2635 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1W2PP18 115 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 C9JVG2 144 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 NPIPA2E9PIF3 369 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 NPIPA3F8WFD2 350 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 PGRMC2O15173 223 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR2C1O95371 312 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 OAS1P00973 400 aaKnown RBP-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 LYNP07948 512 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABCD3P28288 659 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM183BQ1AE95 376 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 PYDC2Q56P42 97 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 ODR4Q5SWX8 454 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 LGSNQ5TDP6 509 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNX30Q5VWJ9 437 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPBP1Q86WP2 473 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNX32Q86XE0 403 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 EGFL6Q8IUX8 553 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM183AQ8IXX5 376 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 CMTM2Q8TAZ6 248 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 METTL6Q8TCB7 284 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPR119Q8TDV5 335 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSKUQ8WUA8 353 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 PYCR2Q96C36 320 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 BPIFA2Q96DR5 249 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 ASB9Q96DX5 294 aa-1.9□□□□□ -2.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms