RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	CD79B	P40259	229 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	MC3R	P41968	323 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	CDH13	P55290	713 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	SIRPA	P78324	504 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	CAV1	Q03135	178 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF550	Q7Z398	422 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF675	Q8TD23	568 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	FIG4	Q92562	907 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	KAT2A	Q92830	837 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	TMCO6	Q96DC7	493 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	CCL19	Q99731	98 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	PRODH2	Q9UF12	536 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	USF3	Q68DE3	2245 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	RTTN	Q86VV8	2226 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	INAFM1	C9JVW0	142 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	ABCB7	O75027	752 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	GUCY1B2	O75343	617 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	CGA	P01215	116 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	CRH	P06850	196 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	IL3	P08700	152 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	CHN1	P15882	459 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	UGT2B10	P36537	528 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	ACKR1	Q16570	336 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	FADS6	Q8N9I5	356 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	PIGT	Q969N2	578 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	PGM2	Q96G03	612 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	MED18	Q9BUE0	208 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB17	Q9H0T7	212 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	BRF2	Q9HAW0	419 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338		A8MT66	165 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	SCO2	O43819	266 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	OR4F21	O95013	312 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	OTC	P00480	354 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	POU2F1	P14859	743 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	IL12B	P29460	328 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	EVI2B	P34910	448 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	PCYT1A	P49585	367 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	CLDN20	P56880	219 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	EFR3A	Q14156	821 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	GUSBP1	Q15486	140 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	BCL2A1	Q16548	175 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2M3	Q8NG83	312 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	OR7G2	Q8NG99	324 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	DSN1	Q9H410	356 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF122	Q9H9V4	155 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	PSME2	Q9UL46	239 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	MANBA	O00462	879 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	SEC14L5	O43304	696 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	SMIM24	O75264	130 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	ESRRB	O95718	433 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	RBP1	P09455	135 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	FPR1	P21462	350 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	HTR6	P50406	440 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	PNLIPRP2	P54317	469 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-233	ENST00000602338	PSG6	Q00889	435 aa		10.75	□□□□□ -0.69

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