RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDE10AQ9Y233 779 aa2.98□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 METP08581 1390 aa2.98□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A0U1RRA0 63 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF861PO60384 105 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACTL6AO96019 429 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGLV1-47P01700 117 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYP11B1P15538 503 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SDC1P18827 310 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMOD1P28289 359 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RFC2P35250 354 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRPC1P48995 793 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LIPKQ5VXJ0 399 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HACD2Q6Y1H2 254 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UNC45BQ8IWX7 931 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PEX5LQ8IYB4 626 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CADM2Q8N3J6 435 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PSMA8Q8TAA3 256 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF138Q8WVD3 245 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF799Q96GE5 643 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NDUFAF3Q9BU61 184 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MID1IP1Q9NPA3 183 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ELOVL2Q9NXB9 296 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYP39A1Q9NYL5 469 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRK1Q38SD2 2015 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H3BMH7 237 aa2.96□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IMPA2O14732 288 aa2.96□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VEGFDO43915 354 aa2.96□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC166P0CW27 439 aa2.96□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPC3P51654 580 aa2.96□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SSTP61278 116 aa2.96□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPS6P62753 249 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MEDAGQ5VYS4 303 aa2.96□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LEG1Q6P5S2 330 aa2.96□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TFAP2EQ6VUC0 442 aa2.96□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MOB1BQ7L9L4 216 aa2.96□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC91Q7Z6B0 441 aa2.96□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPBP1Q86WP2 473 aa2.96□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC36Q8IYA8 594 aa2.96□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MCOLN2Q8IZK6 566 aa2.96□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM185AQ8NFB2 350 aa2.96□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EEF2KMTQ96G04 330 aa2.96□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HMG20BQ9P0W2 317 aa2.96□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FZR1Q9UM11 496 aa2.96□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USP6P35125 1406 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR7A17O14581 309 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PROS1P07225 676 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABHD2P08910 425 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GNSP15586 552 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR3A4PP47883 348 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC6A8P48029 635 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CASP9P55211 416 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NOP14P78316 857 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PSG7Q13046 419 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAB35Q15286 201 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IL17AQ16552 155 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRIT3Q3SXY7 679 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC14Q49A88 953 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AGKQ53H12 422 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPATA46Q5T0L3 261 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PNCKQ6P2M8 343 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PARGQ86W56 976 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRC17Q8N6Y2 441 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PHYHIPQ92561 330 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRT35Q92764 455 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ELSPBP1Q96BH3 223 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPATA13Q96N96 652 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLEKHF1Q96S99 279 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COQ7Q99807 217 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 Q9H3A6 140 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EHD1Q9H4M9 534 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM10Q9UDY6 481 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FKBP7Q9Y680 259 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM170AA1A519 330 aa2.94□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WWP2O00308 870 aa2.94□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EMC8O43402 210 aa2.94□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAMP1O60894 148 aa2.94□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MDKP21741 143 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UGT1A3P35503 534 aa2.94□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAGEA4P43358 317 aa2.94□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SRP54P61011 504 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPA4Q13156 261 aa2.94□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KYAT1Q16773 422 aa2.94□□□□□ -1.94
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms