RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429762.7

VSX1-205, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSX1, Length 1,977 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-205ENST00000429762 USE1Q9NZ43 259 aa20.54■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 CHST2Q9Y4C5 530 aa20.54■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa20.53■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 DNAJB5O75953 348 aa20.53■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 HPRP00739 348 aa20.53■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 CCL4P13236 92 aa20.53■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 CD59P13987 128 aa20.53■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 PSG6Q00889 435 aa20.53■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 SLC36A3Q495N2 470 aa20.53■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 NPSR1Q6W5P4 371 aa20.53■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 CYP4Z1Q86W10 505 aa20.53■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 PPP1R3BQ86XI6 285 aa20.53■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 DHRSXQ8N5I4 330 aa20.53■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 OR4C15Q8NGM1 316 aa20.53■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 RASSF5Q8WWW0 418 aa20.53■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 PMEPA1Q969W9 287 aa20.53■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 STACQ99469 402 aa20.53■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 VN1R1Q9GZP7 353 aa20.53■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa20.53■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 OR10A5Q9H207 317 aa20.53■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 CTPS2Q9NRF8 586 aa20.53■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 RLIMQ9NVW2 624 aa20.53■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 ZNF318Q5VUA4 2279 aa20.53■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 ADAMDEC1O15204 470 aa20.52■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 ALBP02768 609 aa20.52■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 IFI6P09912 130 aa20.52■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 ARHGDIAP52565 204 aa20.52■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 SPEM2Q0P670 501 aa20.52■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 LCN10Q6JVE6 187 aa20.52■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa20.52■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 LANCL3Q6ZV70 420 aa20.52■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 ZNF605Q86T29 641 aa20.52■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 CLIP4Q8N3C7 705 aa20.52■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 C16orf52Q8NHV5 167 aa20.52■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 VSTM2LQ96N03 204 aa20.52■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 MESP1Q9BRJ9 268 aa20.52■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 PINK1Q9BXM7 581 aa20.52■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa20.52■□□□□ 0.88
VSX1-205ENST00000429762 PEX12O00623 359 aa20.52■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 PCDH17O14917 1159 aa20.52■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 NKX2-2O95096 273 aa20.52■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 LYNP07948 512 aa20.52■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 CAPGP40121 348 aa20.52■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 FUT7Q11130 342 aa20.52■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 NSDHLQ15738 373 aa20.52■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 MAPK14Q16539 360 aa20.52■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 TCTN3Q6NUS6 607 aa20.52■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 ZNF615Q8N8J6 731 aa20.52■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 OR6T1Q8NGN1 323 aa20.52■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 EDEM2Q9BV94 578 aa20.52■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 ITPAQ9BY32 194 aa20.52■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 OR8D2Q9GZM6 311 aa20.52■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 ZNF350Q9GZX5 532 aa20.52■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 ACER3Q9NUN7 267 aa20.52■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 PRAMEF2O60811 474 aa20.51■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 LGI1O95970 557 aa20.51■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 RHCEP18577 417 aa20.51■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 PIGAP37287 484 aa20.51■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 HOXC5Q00444 222 aa20.51■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 NPTX1Q15818 432 aa20.51■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa20.51■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 ANKRD60Q9BZ19 345 aa20.51■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 KIF17Q9P2E2 1029 aa20.51■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 KIF26BQ2KJY2 2108 aa20.51■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 DPM1O60762 260 aa20.5■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 KCNK2O95069 426 aa20.5■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 GADD45GO95257 159 aa20.5■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 IGKV1D-16P01601 117 aa20.5■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 ZNF28P17035 718 aa20.5■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 IGFBP5P24593 272 aa20.5■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 MYBPC1Q00872 1141 aa20.5■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 ZNF836Q6ZNA1 936 aa20.5■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 NAXDQ8IW45 347 aa20.5■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 ATG16L2Q8NAA4 619 aa20.5■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 STT3BQ8TCJ2 826 aa20.5■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 KCNE5Q9UJ90 142 aa20.5■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa20.5■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 STX11O75558 287 aa20.5■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 CYP4B1P13584 511 aa20.5■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 CHN2P52757 468 aa20.5■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
VSX1-205ENST00000429762 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.7 ms