RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530295.5

NDUFS3-208, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, human

TSL 3

Gene NDUFS3, Length 253 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NDUFS3-208	ENST00000530295	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	TMCO6	Q96DC7	493 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	PINK1	Q9BXM7	581 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	REG4	Q9BYZ8	158 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	RAB21	Q9UL25	225 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	PROCR	Q9UNN8	238 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	CUBN	O60494	3623 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	EMC8	O43402	210 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	ZIC3	O60481	467 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	DPP4	P27487	766 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	CUL3	Q13618	768 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	LIPJ	Q5W064	366 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	13.6	□□□□□ -0.23	6e-8	■■■■□ 22.1
NDUFS3-208	ENST00000530295	RAPH1	Q70E73	1250 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	ISCA2	Q86U28	154 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	TMBIM1	Q969X1	311 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	REPS1	Q96D71	796 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	RAB17	Q9H0T7	212 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	PLLP	Q9Y342	182 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	FAM187A	A6NFU0	413 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295		H0YC42	278 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	ACOX3	O15254	700 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	SEC14L5	O43304	696 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	KLF4	O43474	513 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	SOX30	O94993	753 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	CGA	P01215	116 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	KLK1	P06870	262 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	THBD	P07204	575 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	PEPD	P12955	493 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	RAB10	P61026	200 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	DLG1	Q12959	904 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	COL21A1	Q96P44	957 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	ADO	Q96SZ5	270 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	GPR22	Q99680	433 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NDUFS3-208	ENST00000530295	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	C17orf51	A8MQB3	221 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295		H0YIV9	168 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	HS3ST1	O14792	307 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	ATP8B1	O43520	1251 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	ABCB7	O75027	752 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	CD8B	P10966	210 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	DRD5	P21918	477 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	GRK2	P25098	689 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	SSTR1	P30872	391 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	CLDN15	P56746	228 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	MGAT2	Q10469	447 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	MAP4K2	Q12851	820 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	BCL2A1	Q16548	175 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	RAET1L	Q5VY80	246 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	ZNF611	Q8N823	705 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	CDKL2	Q92772	493 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	CAVIN3	Q969G5	261 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	SERPINI1	Q99574	410 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	RBBP8	Q99708	897 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NDUFS3-208	ENST00000530295	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24

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