RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460778.1

RPL23AP56-201, Transcript of ribosomal protein L23a pseudogene 56, humanhuman

BASIC

Gene RPL23AP56, Length 453 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP56-201ENST00000460778 PSMG1O95456 288 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 C6orf47O95873 294 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 GSNP06396 782 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 PGRP06401 933 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 CT45A8P0DMV1 189 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 CT45A9P0DMV2 189 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
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RPL23AP56-201ENST00000460778 CDKN2CP42773 168 aa4.55□□□□□ -1.68
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RPL23AP56-201ENST00000460778 CD97P48960 835 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 ATP4BP51164 291 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 PGDP52209 483 aa4.55□□□□□ -1.68
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RPL23AP56-201ENST00000460778 MLC1Q15049 377 aa4.55□□□□□ -1.68
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RPL23AP56-201ENST00000460778 VPS26BQ4G0F5 336 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 CT45A2Q5DJT8 189 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 PAGE3Q5JUK9 113 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 TCTN3Q6NUS6 607 aa4.55□□□□□ -1.68
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RPL23AP56-201ENST00000460778 DLEU7Q6UYE1 221 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 GPR155Q7Z3F1 870 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 ANKRD46Q86W74 232 aa4.55□□□□□ -1.68
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RPL23AP56-201ENST00000460778 MSRB3Q8IXL7 192 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 C9orf40Q8IXQ3 194 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 KBTBD2Q8IY47 623 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 MIER2Q8N344 545 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 GALNT16Q8N428 558 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 SIRT6Q8N6T7 355 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 ZNF441Q8N8Z8 693 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 OR14A16Q8NHC5 309 aa4.55□□□□□ -1.68
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RPL23AP56-201ENST00000460778 GIMAP5Q96F15 307 aa4.55□□□□□ -1.68
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RPL23AP56-201ENST00000460778 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 OR52E6Q96RD3 313 aa4.55□□□□□ -1.68
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RPL23AP56-201ENST00000460778 OR10A5Q9H207 317 aa4.55□□□□□ -1.68
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RPL23AP56-201ENST00000460778 STMN3Q9NZ72 180 aa4.55□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 ZIM2Q9NZV7 527 aa4.55□□□□□ -1.68
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RPL23AP56-201ENST00000460778 ARMCX1Q9P291 453 aa4.55□□□□□ -1.68
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RPL23AP56-201ENST00000460778 SHANK1Q9Y566 2161 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 A0A087WV62 115 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa4.54□□□□□ -1.68
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RPL23AP56-201ENST00000460778 LOC100653049A0A140TA62 436 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 A0A1W2PP18 115 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 CCDC154A6NI56 674 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 CAPN14A8MX76 684 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 WWP2O00308 870 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 PDPK1O15530 556 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 OR2J2O76002 312 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 KRT34O76011 436 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 WISP2O76076 250 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 ZFAND5O76080 213 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 NADKO95544 446 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 FAM107AO95990 144 aa4.54□□□□□ -1.68
RPL23AP56-201ENST00000460778 F10P00742 488 aa4.54□□□□□ -1.68
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