RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 ZNF562Q6V9R5 426 aa5.3□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 Q6ZRG5 221 aa5.3□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa5.3□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 ASRGL1Q7L266 308 aa5.3□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 LRRC43Q8N309 656 aa5.3□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 DDB2Q92466 427 aa5.3□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 RAPGEF5Q92565 580 aa5.3□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 RHOJQ9H4E5 214 aa5.3□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 GAREM1Q9H706 876 aa5.3□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 LRRC4Q9HBW1 653 aa5.3□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 C1orf123Q9NWV4 160 aa5.3□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 PISDQ9UG56 409 aa5.3□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 FZR1Q9UM11 496 aa5.3□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 RNF6Q9Y252 685 aa5.3□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 NEDD4P46934 1319 aa5.3□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 PAX4O43316 350 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 LRCH4O75427 683 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 UPK3AO75631 287 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 CDK2AP2O75956 126 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 DFFBO76075 338 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 NDUFB10O96000 172 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 FCER2P06734 321 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 OR8G3PP0DMU2 310 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 DBTP11182 482 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 FHITP49789 147 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 DCDC1P59894 354 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 ZP4Q12836 540 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 ITPK1Q13572 414 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 CTSL3PQ5NE16 218 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 FAM89BQ8N5H3 189 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 CCDC185Q8N715 623 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 ZNF383Q8NA42 475 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 TCP11Q8WWU5 503 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 RTP4Q96DX8 246 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 AKR1E2Q96JD6 320 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 AMDHD1Q96NU7 426 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 TGM7Q96PF1 710 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 CITED1Q99966 193 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 SLC25A19Q9HC21 320 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 OCIAD1Q9NX40 245 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 GPR83Q9NYM4 423 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 HACD3Q9P035 362 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 ABCA8O94911 1581 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 GLTPD2A6NH11 291 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 TCP11X1B4DZS4 312 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 ARHGEF9O43307 516 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 SPOPO43791 374 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 TSPAN2O60636 221 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 TOXO94900 526 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 FGF19O95750 216 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 OPN1LWP04000 364 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 GSTT2P0CG29 244 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 GSTT2BP0CG30 244 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 FAM157CP0CG43 387 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 FGF5P12034 268 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 UQCRBP14927 111 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP5.29□□□□□ -1.562e-8■□□□□ 10.8
MDM2-201ENST00000258148 CDC25AP30304 524 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 CCT3P49368 545 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 CASP4P49662 377 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 ELLP55199 621 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 CARD18P57730 90 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 SRYQ05066 204 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 DOC2AQ14183 400 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 TFDP1Q14186 410 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 GGTA1PQ4G0N0 100 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 SIRPB2Q5JXA9 342 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 STEAP1BQ6NZ63 245 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 LEKR1Q6ZMV7 388 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 FCRLAQ7L513 359 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 P4HA3Q7Z4N8 544 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 GGNQ86UU5 652 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 IQCF2Q8IXL9 164 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 SLC38A6Q8IZM9 456 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 SLC22A8Q8TCC7 542 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 TMED6Q8WW62 240 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 NSL1Q96IY1 281 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 NLGN3Q9NZ94 848 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 ADAM28Q9UKQ2 775 aa5.29□□□□□ -1.56
MDM2-201ENST00000258148 IKZF3Q9UKT9 509 aa5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms