RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267970.8

TSPAN3-201, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN3, Length 6,467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-201ENST00000267970 CYP8B1Q9UNU6 501 aa16.06■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 LEFTY2O00292 366 aa16.06■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 RETP07949 1114 aa16.06■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 OR8U9P0C7N5 309 aa16.06■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 TM4SF1P30408 202 aa16.06■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 SPHARQ15513 63 aa16.06■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 ACDQ96AP0 544 aa16.06■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 PTERQ96BW5 349 aa16.06■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 NEDD4LQ96PU5 975 aa16.06■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 ARMC1Q9NVT9 282 aa16.06■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 STUB1Q9UNE7 303 aa16.06■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 NPRL3Q12980 569 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 GTDC1Q4AE62 458 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 C6orf89Q6UWU4 347 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 OR52P1PQ8NH57 321 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 RXFP3Q9NSD7 469 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 KCMF1Q9P0J7 381 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 SLC1A7O00341 560 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 ETV4P43268 484 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 FPGSQ05932 587 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 AWAT2Q6E213 333 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 NETO1Q8TDF5 533 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 GPRC5BQ9NZH0 403 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 TMEM59LQ9UK28 342 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 K7ERQ8 282 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 BMP1P13497 986 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 BRAT1Q6PJG6 821 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 OR4K3Q96R72 315 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 CRYZL1O95825 349 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 ALDOBP05062 364 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 ARAFP10398 606 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 PIK3CBP42338 1070 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 FGL2Q14314 439 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 RAET1LQ5VY80 246 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 PNPLA2Q96AD5 504 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 IFNGR1P15260 489 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 PRKXP51817 358 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 GALNT2Q10471 571 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 UGT2A3Q6UWM9 527 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 CYB561A3Q8NBI2 242 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 OR8K5Q8NH50 307 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 TOMM40LQ969M1 308 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 RETREG1Q9H6L5 497 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 A0A1W2PP55 124 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 PPP1R3DO95685 299 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 ADRB3P13945 408 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 OPRL1P41146 370 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 TBPL1P62380 186 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 GHRHRQ02643 423 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 DEFB110Q30KQ9 67 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 DCUN1D4Q92564 292 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 IGSF8Q969P0 613 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 MICU1Q9BPX6 476 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 SCML2Q9UQR0 700 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 SHOXO15266 292 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 HOXD13P35453 343 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 RAB15P59190 212 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 HNF4GQ14541 408 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 GID4Q8IVV7 300 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 PDZD9Q8IXQ8 264 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 FNDC8Q8TC99 324 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 SUSD3Q96L08 255 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 FEVQ99581 238 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 NPIPA7E9PJI5 369 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 PET100P0DJ07 73 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 NPIPA8P0DM63 369 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 SLC11A1P49279 550 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 TDGQ13569 410 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 MBTPS1Q14703 1052 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 MRGPRX2Q96LB1 330 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF599Q96NL3 588 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 SMOC2Q9H3U7 446 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 CRTAC1Q9NQ79 661 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 CRISP1P54107 249 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 DESI1Q6ICB0 168 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 KCNN1Q92952 543 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 TUBA1CQ9BQE3 449 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 CNIH4Q9P003 139 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPAN3-201ENST00000267970 COQ4Q9Y3A0 265 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms