RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa6.02□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 C17orf105B2RV13 164 aa6.02□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 RTCAO00442 366 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
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HOXD8-202ENST00000429017 MTTPP55157 894 aa6.01□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 DOC2AQ14183 400 aa6.01□□□□□ -1.45
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HOXD8-202ENST00000429017 WLSQ5T9L3 541 aa6.01□□□□□ -1.45
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HOXD8-202ENST00000429017 KIAA1191Q96A73 305 aa6.01□□□□□ -1.45
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HOXD8-202ENST00000429017 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 LDAHQ9H6V9 325 aa6.01□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 SMYD2Q9NRG4 433 aa6.01□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.01□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
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