RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637578.1

CLN3-260, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 2

Gene CLN3, Length 1,577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-260ENST00000637578 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa25.14■■□□□ 1.62
CLN3-260ENST00000637578 C2CD5Q86YS7 1000 aa25.14■■□□□ 1.62
CLN3-260ENST00000637578 CNBD1Q8NA66 436 aa25.14■■□□□ 1.62
CLN3-260ENST00000637578 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.14■■□□□ 1.61
CLN3-260ENST00000637578 H0YIN7 160 aa25.14■■□□□ 1.61
CLN3-260ENST00000637578 ZNF853P0CG23 659 aa25.14■■□□□ 1.61
CLN3-260ENST00000637578 MYL6BP14649 208 aa25.14■■□□□ 1.61
CLN3-260ENST00000637578 PDE6BP35913 854 aa25.14■■□□□ 1.61
CLN3-260ENST00000637578 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.14■■□□□ 1.61
CLN3-260ENST00000637578 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.13■■□□□ 1.61
CLN3-260ENST00000637578 NGEFQ8N5V2 710 aa25.13■■□□□ 1.61
CLN3-260ENST00000637578 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
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CLN3-260ENST00000637578 KRT24Q2M2I5 525 aa25.11■■□□□ 1.61
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CLN3-260ENST00000637578 ATP10DQ9P241 1426 aa25.1■■□□□ 1.61
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CLN3-260ENST00000637578 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.1■■□□□ 1.61
CLN3-260ENST00000637578 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.1■■□□□ 1.61
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CLN3-260ENST00000637578 PROSER3Q2NL68 480 aa25.09■■□□□ 1.61
CLN3-260ENST00000637578 MBIPQ9NS73 344 aa25.09■■□□□ 1.61
CLN3-260ENST00000637578 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
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CLN3-260ENST00000637578 CCDC27Q2M243 656 aa25.05■■□□□ 1.6
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CLN3-260ENST00000637578 STYK1Q6J9G0 422 aa25.05■■□□□ 1.6
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CLN3-260ENST00000637578 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
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CLN3-260ENST00000637578 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
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CLN3-260ENST00000637578 C9orf131Q5VYM1 1079 aa25.01■■□□□ 1.59
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CLN3-260ENST00000637578 CNKSR1Q969H4 720 aa25.01■■□□□ 1.59
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CLN3-260ENST00000637578 FAM177BA6PVY3 158 aa25■■□□□ 1.59
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CLN3-260ENST00000637578 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
CLN3-260ENST00000637578 PARP10Q53GL7 1025 aa24.97■■□□□ 1.59
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CLN3-260ENST00000637578 C1QTNF8P60827 252 aa24.97■■□□□ 1.59
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CLN3-260ENST00000637578 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.94■■□□□ 1.58
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CLN3-260ENST00000637578 IL16Q14005 1332 aa24.94■■□□□ 1.58
CLN3-260ENST00000637578 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.93■■□□□ 1.58
CLN3-260ENST00000637578 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.92■■□□□ 1.58
CLN3-260ENST00000637578 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CLN3-260ENST00000637578 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.92■■□□□ 1.58
CLN3-260ENST00000637578 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CLN3-260ENST00000637578 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.92■■□□□ 1.58
CLN3-260ENST00000637578 SOGA3Q5TF21 947 aa24.92■■□□□ 1.58
CLN3-260ENST00000637578 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.92■■□□□ 1.58
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