RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, human

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ANKRD28-215	ENST00000624145	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	TMX1	Q9H3N1	280 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC7	Q96M83	1385 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	MYO1B	O43795	1136 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	STARD3NL	O95772	234 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCT6B	Q92526	530 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	ALDH3A1	P30838	453 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	CFAP157	Q5JU67	520 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	CEP120	Q8N960	986 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	STAC3	Q96MF2	364 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	HYPK	Q9NX55	129 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	SOGA1	O94964	1423 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	ESPN	B1AK53	854 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	PHACTR2	O75167	634 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	IDE	P14735	1019 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	MAP3K12	Q12852	859 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	TAF12	Q16514	161 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	CABP5	Q9NP86	173 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	SYCE3	A1L190	88 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67	3e-8	■□□□□ 9.7
ANKRD28-215	ENST00000624145	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	CRCP	O75575	148 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	STIM2	Q9P246	746 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	TACC1	O75410	805 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	GAS8	O95995	478 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	KRT13	P13646	458 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	ERMN	Q8TAM6	284 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZNF428	Q96B54	188 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	BTBD11	A6QL63	1104 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	SLC5A1	P13866	664 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	KIF5B	P33176	963 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	KANK3	Q6NY19	840 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	WDR63	Q8IWG1	891 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	TRIM7	Q9C029	511 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	EXOC1	Q9NV70	894 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	PDE3A	Q14432	1141 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	TMC6	Q7Z403	805 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	EPSTI1	Q96J88	318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	CIB2	O75838	187 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	HLA-DOA	P06340	250 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	RFX1	P22670	979 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	STX1A	Q16623	288 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	RSPH3	Q86UC2	560 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	FERMT3	Q86UX7	667 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	HAUS7	Q99871	368 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	RMND1	Q9NWS8	449 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	AKR1B10	O60218	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	OPA1	O60313	960 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	IVL	P07476	585 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	BIRC2	Q13490	618 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	CUL4B	Q13620	913 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ANKRD28-215	ENST00000624145	SPAG5	Q96R06	1193 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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