RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594716.5

MPND-204, Transcript of MPN domain containing, human

TSL 1 (best)

Gene MPND, Length 1,547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MPND-204	ENST00000594716	IL16	Q14005	1332 aa		40.45	■■■■■ 4.07
MPND-204	ENST00000594716	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		40.45	■■■■■ 4.07
MPND-204	ENST00000594716	UTRN	P46939	3433 aa		40.45	■■■■■ 4.07
MPND-204	ENST00000594716	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		40.44	■■■■■ 4.06
MPND-204	ENST00000594716	GRIN3B	O60391	1043 aa		40.44	■■■■■ 4.06
MPND-204	ENST00000594716	DPEP1	P16444	411 aa		40.44	■■■■■ 4.06
MPND-204	ENST00000594716	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	40.44	■■■■■ 4.06
MPND-204	ENST00000594716	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	40.43	■■■■■ 4.06
MPND-204	ENST00000594716	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	40.43	■■■■■ 4.06
MPND-204	ENST00000594716	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		40.43	■■■■■ 4.06
MPND-204	ENST00000594716	HLF	Q16534	295 aa		40.42	■■■■■ 4.06
MPND-204	ENST00000594716	PROSER3	Q2NL68	480 aa		40.42	■■■■■ 4.06
MPND-204	ENST00000594716	ANXA1	P04083	346 aa		40.42	■■■■■ 4.06
MPND-204	ENST00000594716	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	40.42	■■■■■ 4.06
MPND-204	ENST00000594716	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		40.42	■■■■■ 4.06
MPND-204	ENST00000594716	WDR63	Q8IWG1	891 aa		40.42	■■■■■ 4.06
MPND-204	ENST00000594716	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		40.42	■■■■■ 4.06
MPND-204	ENST00000594716	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	40.41	■■■■■ 4.06
MPND-204	ENST00000594716	NPHP1	O15259	732 aa		40.4	■■■■■ 4.06
MPND-204	ENST00000594716	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		40.39	■■■■■ 4.06
MPND-204	ENST00000594716	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		40.39	■■■■■ 4.06
MPND-204	ENST00000594716	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	40.38	■■■■■ 4.06
MPND-204	ENST00000594716	CNBD1	Q8NA66	436 aa		40.38	■■■■■ 4.06
MPND-204	ENST00000594716	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	40.38	■■■■■ 4.06
MPND-204	ENST00000594716	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	40.38	■■■■■ 4.06
MPND-204	ENST00000594716	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		40.37	■■■■■ 4.05
MPND-204	ENST00000594716	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		40.37	■■■■■ 4.05
MPND-204	ENST00000594716	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		40.37	■■■■■ 4.05
MPND-204	ENST00000594716	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	40.36	■■■■■ 4.05
MPND-204	ENST00000594716	KCNA3	P22001	575 aa		40.35	■■■■■ 4.05
MPND-204	ENST00000594716	COPS6	Q7L5N1	327 aa		40.35	■■■■■ 4.05
MPND-204	ENST00000594716	CHRNA5	P30532	468 aa		40.34	■■■■■ 4.05
MPND-204	ENST00000594716	ST5	P78524	1137 aa		40.34	■■■■■ 4.05
MPND-204	ENST00000594716	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	40.34	■■■■■ 4.05
MPND-204	ENST00000594716	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		40.34	■■■■■ 4.05
MPND-204	ENST00000594716	PIM2	Q9P1W9	311 aa		40.34	■■■■■ 4.05
MPND-204	ENST00000594716	NUP98	P52948	1817 aa		40.34	■■■■■ 4.05
MPND-204	ENST00000594716	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		40.33	■■■■■ 4.05
MPND-204	ENST00000594716	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	40.32	■■■■■ 4.05
MPND-204	ENST00000594716	BCS1L	Q9Y276	419 aa		40.32	■■■■■ 4.05
MPND-204	ENST00000594716	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		40.32	■■■■■ 4.04
MPND-204	ENST00000594716	HYPK	Q9NX55	129 aa		40.32	■■■■■ 4.04
MPND-204	ENST00000594716	ATP10D	Q9P241	1426 aa		40.31	■■■■■ 4.04
MPND-204	ENST00000594716	YY1	P25490	414 aa		40.31	■■■■■ 4.04
MPND-204	ENST00000594716	PDE6B	P35913	854 aa		40.3	■■■■■ 4.04
MPND-204	ENST00000594716	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		40.3	■■■■■ 4.04
MPND-204	ENST00000594716	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		40.3	■■■■■ 4.04
MPND-204	ENST00000594716		H0YIN7	160 aa		40.29	■■■■■ 4.04
MPND-204	ENST00000594716	CHD4	Q14839	1912 aa		40.29	■■■■■ 4.04
MPND-204	ENST00000594716	FAM177B	A6PVY3	158 aa		40.28	■■■■■ 4.04
MPND-204	ENST00000594716	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		40.28	■■■■■ 4.04
MPND-204	ENST00000594716	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	40.28	■■■■■ 4.04
MPND-204	ENST00000594716	TSPYL6	Q8N831	410 aa		40.27	■■■■■ 4.04
MPND-204	ENST00000594716	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	40.26	■■■■■ 4.04
MPND-204	ENST00000594716	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		40.26	■■■■■ 4.04
MPND-204	ENST00000594716	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		40.26	■■■■■ 4.04
MPND-204	ENST00000594716	GPT	P24298	496 aa		40.26	■■■■■ 4.03
MPND-204	ENST00000594716	NYX	Q9GZU5	481 aa		40.26	■■■■■ 4.03
MPND-204	ENST00000594716	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	40.25	■■■■■ 4.03
MPND-204	ENST00000594716	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		40.25	■■■■■ 4.03
MPND-204	ENST00000594716	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		40.24	■■■■■ 4.03
MPND-204	ENST00000594716	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		40.23	■■■■■ 4.03
MPND-204	ENST00000594716	GOLGA2	Q08379	1002 aa		40.23	■■■■■ 4.03
MPND-204	ENST00000594716	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	40.23	■■■■■ 4.03
MPND-204	ENST00000594716	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		40.21	■■■■■ 4.03
MPND-204	ENST00000594716	PARP10	Q53GL7	1025 aa		40.21	■■■■■ 4.03
MPND-204	ENST00000594716	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		40.21	■■■■■ 4.03
MPND-204	ENST00000594716	MIER1	Q8N108	512 aa		40.21	■■■■■ 4.03
MPND-204	ENST00000594716	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		40.21	■■■■■ 4.03
MPND-204	ENST00000594716	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		40.2	■■■■■ 4.03
MPND-204	ENST00000594716	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		40.18	■■■■■ 4.02
MPND-204	ENST00000594716	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	40.18	■■■■■ 4.02
MPND-204	ENST00000594716	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	40.18	■■■■■ 4.02
MPND-204	ENST00000594716	ZNF521	Q96K83	1311 aa		40.18	■■■■■ 4.02
MPND-204	ENST00000594716	SUSD4	Q5VX71	490 aa		40.17	■■■■■ 4.02
MPND-204	ENST00000594716	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		40.17	■■■■■ 4.02
MPND-204	ENST00000594716	TTLL6	Q8N841	843 aa		40.17	■■■■■ 4.02
MPND-204	ENST00000594716	TCIRG1	Q13488	830 aa		40.16	■■■■■ 4.02
MPND-204	ENST00000594716	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	40.16	■■■■■ 4.02
MPND-204	ENST00000594716	STK31	Q9BXU1	1019 aa		40.16	■■■■■ 4.02
MPND-204	ENST00000594716	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		40.16	■■■■■ 4.02
MPND-204	ENST00000594716	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	40.15	■■■■■ 4.02
MPND-204	ENST00000594716	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	40.14	■■■■■ 4.02
MPND-204	ENST00000594716	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		40.14	■■■■■ 4.02
MPND-204	ENST00000594716	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		40.13	■■■■■ 4.01
MPND-204	ENST00000594716	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		40.12	■■■■■ 4.01
MPND-204	ENST00000594716	SRGN	P10124	158 aa		40.12	■■■■■ 4.01
MPND-204	ENST00000594716	NTSR2	O95665	410 aa		40.11	■■■■■ 4.01
MPND-204	ENST00000594716	ERFE	Q4G0M1	354 aa		40.11	■■■■■ 4.01
MPND-204	ENST00000594716	MASTL	Q96GX5	879 aa		40.11	■■■■■ 4.01
MPND-204	ENST00000594716	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	40.11	■■■■■ 4.01
MPND-204	ENST00000594716	STYK1	Q6J9G0	422 aa		40.11	■■■■■ 4.01
MPND-204	ENST00000594716	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		40.11	■■■■■ 4.01
MPND-204	ENST00000594716	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	40.11	■■■■■ 4.01
MPND-204	ENST00000594716	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	40.11	■■■■■ 4.01
MPND-204	ENST00000594716	NLRP10	Q86W26	655 aa		40.1	■■■■■ 4.01
MPND-204	ENST00000594716	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	40.09	■■■■■ 4.01
MPND-204	ENST00000594716	CNKSR1	Q969H4	720 aa		40.09	■■■■■ 4.01
MPND-204	ENST00000594716	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	40.08	■■■■■ 4.01
MPND-204	ENST00000594716	VAMP4	O75379	141 aa		40.08	■■■■■ 4.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.6 ms