RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 SETDB2Q96T68 719 aa23.17■■□□□ 1.3
CS-219ENST00000550655 CACNA1SQ13698 1873 aa23.17■■□□□ 1.3
CS-219ENST00000550655 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.17■■□□□ 1.3
CS-219ENST00000550655 PDIA6Q15084 440 aa23.16■■□□□ 1.3
CS-219ENST00000550655 HLFQ16534 295 aa23.16■■□□□ 1.3
CS-219ENST00000550655 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.16■■□□□ 1.3
CS-219ENST00000550655 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CS-219ENST00000550655 NGEFQ8N5V2 710 aa23.15■■□□□ 1.3
CS-219ENST00000550655 MBIPQ9NS73 344 aa23.15■■□□□ 1.3
CS-219ENST00000550655 PIM2Q9P1W9 311 aa23.15■■□□□ 1.3
CS-219ENST00000550655 ATP10DQ9P241 1426 aa23.15■■□□□ 1.3
CS-219ENST00000550655 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.14■■□□□ 1.3
CS-219ENST00000550655 PROSER3Q2NL68 480 aa23.14■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 IFT57Q9NWB7 429 aa23.14■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 ADCY9O60503 1353 aa23.14■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.13■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.13■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 CNBD1Q8NA66 436 aa23.13■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.12■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 BRIP1Q9BX63 1249 aa23.12■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 ANXA1P04083 346 aa23.11■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 HOXB7P09629 217 aa23.11■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.11■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 NECTIN2Q92692 538 aa23.11■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 SBF1O95248 1867 aa23.11■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.1■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 GNAI1P63096 354 aa23.1■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 CCDC27Q2M243 656 aa23.1■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.1■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 H0YIN7 160 aa23.08■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 PDE6BP35913 854 aa23.08■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 ST5P78524 1137 aa23.08■■□□□ 1.29
CS-219ENST00000550655 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.08■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.07■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.07■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 WWC1Q8IX03 1113 aa23.07■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.07■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 SLX4Q8IY92 1834 aa23.07■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 NPHP1O15259 732 aa23.06■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.06■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 TTLL6Q8N841 843 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 ABCC12Q96J65 1359 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 FAM177BA6PVY3 158 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 COPS6Q7L5N1 327 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.03■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 GPTP24298 496 aa23.03■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.03■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 LAMB2P55268 1798 aa23.02■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 SRGNP10124 158 aa23.02■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.02■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.02■■□□□ 1.28
CS-219ENST00000550655 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CS-219ENST00000550655 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CS-219ENST00000550655 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.01■■□□□ 1.27
CS-219ENST00000550655 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CS-219ENST00000550655 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.01■■□□□ 1.27
CS-219ENST00000550655 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CS-219ENST00000550655 IL16Q14005 1332 aa23.01■■□□□ 1.27
CS-219ENST00000550655 NTSR2O95665 410 aa23■■□□□ 1.27
CS-219ENST00000550655 SUSD4Q5VX71 490 aa23■■□□□ 1.27
CS-219ENST00000550655 STYK1Q6J9G0 422 aa23■■□□□ 1.27
CS-219ENST00000550655 NYXQ9GZU5 481 aa23■■□□□ 1.27
CS-219ENST00000550655 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CS-219ENST00000550655 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.99■■□□□ 1.27
CS-219ENST00000550655 MASTLQ96GX5 879 aa22.99■■□□□ 1.27
CS-219ENST00000550655 ERFEQ4G0M1 354 aa22.98■■□□□ 1.27
CS-219ENST00000550655 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CS-219ENST00000550655 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CS-219ENST00000550655 RASSF7Q02833 373 aa22.97■■□□□ 1.27
CS-219ENST00000550655 PARP10Q53GL7 1025 aa22.97■■□□□ 1.27
CS-219ENST00000550655 TSPYL6Q8N831 410 aa22.97■■□□□ 1.27
CS-219ENST00000550655 HYPKQ9NX55 129 aa22.97■■□□□ 1.27
CS-219ENST00000550655 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CS-219ENST00000550655 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CS-219ENST00000550655 CNKSR1Q969H4 720 aa22.96■■□□□ 1.27
CS-219ENST00000550655 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CS-219ENST00000550655 NFKBIEO00221 500 aa22.95■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 NPR1P16066 1061 aa22.95■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 PRELPP51888 382 aa22.95■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 CRY2Q49AN0 593 aa22.95■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.95■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.95■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.95■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.94■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 C21orf2O43822 256 aa22.94■■□□□ 1.26
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