RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa31.45■■■□□ 2.62
PITX3-202ENST00000539804 TPTE2Q6XPS3 522 aa31.44■■■□□ 2.62
PITX3-202ENST00000539804 MBIPQ9NS73 344 aa31.44■■■□□ 2.62
PITX3-202ENST00000539804 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
PITX3-202ENST00000539804 H0YIN7 160 aa31.43■■■□□ 2.62
PITX3-202ENST00000539804 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
PITX3-202ENST00000539804 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
PITX3-202ENST00000539804 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP31.43■■■□□ 2.62
PITX3-202ENST00000539804 BCS1LQ9Y276 419 aa31.43■■■□□ 2.62
PITX3-202ENST00000539804 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa31.42■■■□□ 2.62
PITX3-202ENST00000539804 NYXQ9GZU5 481 aa31.42■■■□□ 2.62
PITX3-202ENST00000539804 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP31.42■■■□□ 2.62
PITX3-202ENST00000539804 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
PITX3-202ENST00000539804 IL16Q14005 1332 aa31.41■■■□□ 2.62
PITX3-202ENST00000539804 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa31.41■■■□□ 2.62
PITX3-202ENST00000539804 PRR5LQ6MZQ0 368 aa31.4■■■□□ 2.62
PITX3-202ENST00000539804 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
PITX3-202ENST00000539804 DUSP27Q5VZP5 1158 aa31.39■■■□□ 2.62
PITX3-202ENST00000539804 WWC1Q8IX03 1113 aa31.39■■■□□ 2.62
PITX3-202ENST00000539804 KCNA3P22001 575 aa31.38■■■□□ 2.61
PITX3-202ENST00000539804 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa31.38■■■□□ 2.61
PITX3-202ENST00000539804 FAM9BQ8IZU0 186 aa31.38■■■□□ 2.61
PITX3-202ENST00000539804 ATP10DQ9P241 1426 aa31.38■■■□□ 2.61
PITX3-202ENST00000539804 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
PITX3-202ENST00000539804 C2CD5Q86YS7 1000 aa31.37■■■□□ 2.61
PITX3-202ENST00000539804 PDIA6Q15084 440 aa31.36■■■□□ 2.61
PITX3-202ENST00000539804 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
PITX3-202ENST00000539804 WDR63Q8IWG1 891 aa31.36■■■□□ 2.61
PITX3-202ENST00000539804 HYPKQ9NX55 129 aa31.36■■■□□ 2.61
PITX3-202ENST00000539804 CHRNA5P30532 468 aa31.35■■■□□ 2.61
PITX3-202ENST00000539804 TTLL7Q6ZT98 887 aa31.35■■■□□ 2.61
PITX3-202ENST00000539804 TTLL6Q8N841 843 aa31.35■■■□□ 2.61
PITX3-202ENST00000539804 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
PITX3-202ENST00000539804 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
PITX3-202ENST00000539804 HLFQ16534 295 aa31.34■■■□□ 2.61
PITX3-202ENST00000539804 PARP10Q53GL7 1025 aa31.34■■■□□ 2.61
PITX3-202ENST00000539804 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa31.33■■■□□ 2.61
PITX3-202ENST00000539804 ZBTB3Q9H5J0 574 aa31.33■■■□□ 2.61
PITX3-202ENST00000539804 WWC3Q9ULE0 1092 aa31.33■■■□□ 2.61
PITX3-202ENST00000539804 UTRNP46939 3433 aa31.33■■■□□ 2.61
PITX3-202ENST00000539804 LRP10Q7Z4F1 713 aa31.32■■■□□ 2.6
PITX3-202ENST00000539804 NECTIN2Q92692 538 aa31.32■■■□□ 2.6
PITX3-202ENST00000539804 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
PITX3-202ENST00000539804 KRT24Q2M2I5 525 aa31.31■■■□□ 2.6
PITX3-202ENST00000539804 COPS6Q7L5N1 327 aa31.31■■■□□ 2.6
PITX3-202ENST00000539804 CNKSR1Q969H4 720 aa31.31■■■□□ 2.6
PITX3-202ENST00000539804 CHPF2Q9P2E5 772 aa31.31■■■□□ 2.6
PITX3-202ENST00000539804 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa31.31■■■□□ 2.6
PITX3-202ENST00000539804 CCER2I3L3R5 266 aa31.3■■■□□ 2.6
PITX3-202ENST00000539804 CCDC30Q5VVM6 783 aa31.3■■■□□ 2.6
PITX3-202ENST00000539804 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa31.3■■■□□ 2.6
PITX3-202ENST00000539804 RNF123Q5XPI4 1314 aa31.29■■■□□ 2.6
PITX3-202ENST00000539804 NUP98P52948 1817 aa31.29■■■□□ 2.6
PITX3-202ENST00000539804 STYK1Q6J9G0 422 aa31.29■■■□□ 2.6
PITX3-202ENST00000539804 XAGE3Q8WTP9 111 aa31.29■■■□□ 2.6
PITX3-202ENST00000539804 DLEC1Q9Y238 1755 aa31.28■■■□□ 2.6
PITX3-202ENST00000539804 PROSER3Q2NL68 480 aa31.28■■■□□ 2.6
PITX3-202ENST00000539804 ZNF34Q8IZ26 560 aa31.28■■■□□ 2.6
PITX3-202ENST00000539804 MASTLQ96GX5 879 aa31.28■■■□□ 2.6
PITX3-202ENST00000539804 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
PITX3-202ENST00000539804 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP31.27■■■□□ 2.6
PITX3-202ENST00000539804 SOGA3Q5TF21 947 aa31.26■■■□□ 2.59
PITX3-202ENST00000539804 PLBD2Q8NHP8 589 aa31.26■■■□□ 2.59
PITX3-202ENST00000539804 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa31.25■■■□□ 2.59
PITX3-202ENST00000539804 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
PITX3-202ENST00000539804 ANXA1P04083 346 aa31.24■■■□□ 2.59
PITX3-202ENST00000539804 SRGNP10124 158 aa31.24■■■□□ 2.59
PITX3-202ENST00000539804 NPR1P16066 1061 aa31.24■■■□□ 2.59
PITX3-202ENST00000539804 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
PITX3-202ENST00000539804 STK31Q9BXU1 1019 aa31.24■■■□□ 2.59
PITX3-202ENST00000539804 FAM177BA6PVY3 158 aa31.23■■■□□ 2.59
PITX3-202ENST00000539804 GOLGA2Q08379 1002 aa31.23■■■□□ 2.59
PITX3-202ENST00000539804 MYH16Q9H6N6 1097 aa31.23■■■□□ 2.59
PITX3-202ENST00000539804 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
PITX3-202ENST00000539804 DDX58O95786 925 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
PITX3-202ENST00000539804 GPTP24298 496 aa31.22■■■□□ 2.59
PITX3-202ENST00000539804 TCIRG1Q13488 830 aa31.22■■■□□ 2.59
PITX3-202ENST00000539804 C8orf58Q8NAV2 365 aa31.22■■■□□ 2.59
PITX3-202ENST00000539804 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
PITX3-202ENST00000539804 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa31.22■■■□□ 2.59
PITX3-202ENST00000539804 RIC1Q4ADV7 1423 aa31.22■■■□□ 2.59
PITX3-202ENST00000539804 ALDH1B1P30837 517 aa31.21■■■□□ 2.59
PITX3-202ENST00000539804 CCDC24Q8N4L8 307 aa31.2■■■□□ 2.59
PITX3-202ENST00000539804 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
PITX3-202ENST00000539804 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
PITX3-202ENST00000539804 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
PITX3-202ENST00000539804 SUSD4Q5VX71 490 aa31.19■■■□□ 2.58
PITX3-202ENST00000539804 UBN2Q6ZU65 1347 aa31.19■■■□□ 2.58
PITX3-202ENST00000539804 NTSR2O95665 410 aa31.16■■■□□ 2.58
PITX3-202ENST00000539804 RIC3Q7Z5B4 369 aa31.16■■■□□ 2.58
PITX3-202ENST00000539804 FANCIQ9NVI1 1328 aa31.16■■■□□ 2.58
PITX3-202ENST00000539804 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
PITX3-202ENST00000539804 ERFEQ4G0M1 354 aa31.15■■■□□ 2.58
PITX3-202ENST00000539804 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
PITX3-202ENST00000539804 NLRP3Q96P20 1036 aa31.15■■■□□ 2.58
PITX3-202ENST00000539804 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa31.15■■■□□ 2.58
PITX3-202ENST00000539804 NLRP10Q86W26 655 aa31.14■■■□□ 2.58
PITX3-202ENST00000539804 NUTM1Q86Y26 1132 aa31.14■■■□□ 2.58
PITX3-202ENST00000539804 ADCY9O60503 1353 aa31.14■■■□□ 2.58
PITX3-202ENST00000539804 CRY2Q49AN0 593 aa31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.8 ms