RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527225.1

SPCS2-204, Transcript of signal peptidase complex subunit 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPCS2, Length 321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS2-204ENST00000527225 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SPCS2-204ENST00000527225 SBF1O95248 1867 aa22.37■■□□□ 1.17
SPCS2-204ENST00000527225 CHL1O00533 1208 aa22.37■■□□□ 1.17
SPCS2-204ENST00000527225 PDE6BP35913 854 aa22.37■■□□□ 1.17
SPCS2-204ENST00000527225 NGEFQ8N5V2 710 aa22.37■■□□□ 1.17
SPCS2-204ENST00000527225 ST5P78524 1137 aa22.36■■□□□ 1.17
SPCS2-204ENST00000527225 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.35■■□□□ 1.17
SPCS2-204ENST00000527225 MYL6BP14649 208 aa22.35■■□□□ 1.17
SPCS2-204ENST00000527225 HLFQ16534 295 aa22.35■■□□□ 1.17
SPCS2-204ENST00000527225 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SPCS2-204ENST00000527225 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.35■■□□□ 1.17
SPCS2-204ENST00000527225 TTLL6Q8N841 843 aa22.35■■□□□ 1.17
SPCS2-204ENST00000527225 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
SPCS2-204ENST00000527225 CACNA1SQ13698 1873 aa22.34■■□□□ 1.17
SPCS2-204ENST00000527225 APAF1O14727 1248 aa22.34■■□□□ 1.17
SPCS2-204ENST00000527225 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SPCS2-204ENST00000527225 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.34■■□□□ 1.17
SPCS2-204ENST00000527225 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SPCS2-204ENST00000527225 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.33■■□□□ 1.17
SPCS2-204ENST00000527225 CCDC184Q52MB2 194 aa22.33■■□□□ 1.17
SPCS2-204ENST00000527225 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.33■■□□□ 1.17
SPCS2-204ENST00000527225 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.32■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 ANP32CO43423 234 aa22.32■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.32■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.32■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 CFAP44Q96MT7 982 aa22.31■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 PDIA6Q15084 440 aa22.3■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.29■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.29■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 SLX4Q8IY92 1834 aa22.29■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 SRGNP10124 158 aa22.28■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 KRT24Q2M2I5 525 aa22.28■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.28■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.28■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 FAM177BA6PVY3 158 aa22.27■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 HOXB7P09629 217 aa22.27■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 C1QTNF8P60827 252 aa22.27■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 PROSER3Q2NL68 480 aa22.27■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 STYK1Q6J9G0 422 aa22.27■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 NECTIN2Q92692 538 aa22.27■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 CNKSR1Q969H4 720 aa22.27■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 MASTLQ96GX5 879 aa22.27■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.27■■□□□ 1.16
SPCS2-204ENST00000527225 ANXA1P04083 346 aa22.26■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 ZNF853P0CG23 659 aa22.26■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 NYXQ9GZU5 481 aa22.26■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 MRS2Q9HD23 443 aa22.26■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 MBIPQ9NS73 344 aa22.26■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 IFT57Q9NWB7 429 aa22.26■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 GNAI1P63096 354 aa22.25■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 RNF181Q9P0P0 153 aa22.25■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 RASSF7Q02833 373 aa22.24■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.24■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 GPTP24298 496 aa22.23■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.23■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 COPS6Q7L5N1 327 aa22.23■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.23■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 C21orf2O43822 256 aa22.22■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 NPR1P16066 1061 aa22.22■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 LMNB1P20700 586 aa22.22■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.22■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.22■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 PARP10Q53GL7 1025 aa22.21■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.21■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SPCS2-204ENST00000527225 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.2■■□□□ 1.14
SPCS2-204ENST00000527225 NFKBIEO00221 500 aa22.2■■□□□ 1.14
SPCS2-204ENST00000527225 SUSD4Q5VX71 490 aa22.2■■□□□ 1.14
SPCS2-204ENST00000527225 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.2■■□□□ 1.14
SPCS2-204ENST00000527225 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SPCS2-204ENST00000527225 ABCC12Q96J65 1359 aa22.2■■□□□ 1.14
SPCS2-204ENST00000527225 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.2■■□□□ 1.14
SPCS2-204ENST00000527225 CCDC27Q2M243 656 aa22.19■■□□□ 1.14
SPCS2-204ENST00000527225 ERFEQ4G0M1 354 aa22.19■■□□□ 1.14
SPCS2-204ENST00000527225 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.19■■□□□ 1.14
SPCS2-204ENST00000527225 SOGA3Q5TF21 947 aa22.19■■□□□ 1.14
SPCS2-204ENST00000527225 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.19■■□□□ 1.14
SPCS2-204ENST00000527225 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SPCS2-204ENST00000527225 NTSR2O95665 410 aa22.18■■□□□ 1.14
SPCS2-204ENST00000527225 KIF3CO14782 793 aa22.17■■□□□ 1.14
SPCS2-204ENST00000527225 ALDH1B1P30837 517 aa22.17■■□□□ 1.14
SPCS2-204ENST00000527225 PRELPP51888 382 aa22.17■■□□□ 1.14
SPCS2-204ENST00000527225 CRY2Q49AN0 593 aa22.17■■□□□ 1.14
SPCS2-204ENST00000527225 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SPCS2-204ENST00000527225 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.16■■□□□ 1.14
SPCS2-204ENST00000527225 HYPKQ9NX55 129 aa22.16■■□□□ 1.14
SPCS2-204ENST00000527225 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.15■■□□□ 1.14
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