RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516032.1

RNU6-1334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1334P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.9□□□□□ -1.14
RNU6-1334P-201ENST00000516032 EXOC5O00471 708 aa7.89□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LIG1P18858 919 aa7.89□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PTK2Q05397 1052 aa7.89□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RASA3Q14644 834 aa7.89□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DESI1Q6ICB0 168 aa7.89□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.89□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 JAMLQ86YT9 394 aa7.89□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CD53P19397 219 aa7.88□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NOS2P35228 1153 aa7.88□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RAB33AQ14088 237 aa7.88□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PPP2R5AQ15172 486 aa7.88□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SLC39A13Q96H72 371 aa7.88□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SEC16BQ96JE7 1060 aa7.88□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DNAJC7Q99615 494 aa7.88□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.88□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.88□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KLF4O43474 513 aa7.87□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TSPAN6O43657 245 aa7.87□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 BPNT1O95861 308 aa7.87□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FOSP01100 380 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RNF20Q5VTR2 975 aa7.87□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SAMD3Q8N6K7 520 aa7.87□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PCGF6Q9BYE7 350 aa7.87□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CHST12Q9NRB3 414 aa7.87□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MAP10Q9P2G4 905 aa7.87□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NRDCO43847 1150 aa7.86□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CNGA1P29973 690 aa7.86□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PACS2Q86VP3 889 aa7.86□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.86□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RASGRP4Q8TDF6 673 aa7.86□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.86□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ARNT2Q9HBZ2 717 aa7.86□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 COPRSQ9NQ92 184 aa7.86□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa7.85□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FGAP02671 866 aa7.85□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LRRC41Q15345 812 aa7.85□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 VPS72Q15906 364 aa7.85□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZNF280DQ6N043 979 aa7.85□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C16orf46Q6P387 395 aa7.85□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C16orf86Q6ZW13 317 aa7.85□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PAF1Q8N7H5 531 aa7.85□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TRPM4Q8TD43 1214 aa7.85□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 JADE2Q9NQC1 790 aa7.85□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SPG7Q9UQ90 795 aa7.85□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa7.85□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.85□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ESPNB1AK53 854 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FOXO3O43524 673 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ALDH1L1O75891 902 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MYL1P05976 194 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IGFBP4P22692 258 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ATP6V1AP38606 617 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TKFCQ3LXA3 575 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LRP10Q7Z4F1 713 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.84□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FBF1Q8TES7 1133 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PPM1EQ8WY54 764 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FEZ1Q99689 392 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PAGR1Q9BTK6 254 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NRBP1Q9UHY1 535 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-1334P-201ENST00000516032 USP31Q70CQ4 1352 aa7.84□□□□□ -1.16
RNU6-1334P-201ENST00000516032 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PLCG2P16885 1265 aa7.83□□□□□ -1.16
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CTHP32929 405 aa7.83□□□□□ -1.16
RNU6-1334P-201ENST00000516032 POU5F1BQ06416 359 aa7.83□□□□□ -1.16
RNU6-1334P-201ENST00000516032 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PCGF5Q86SE9 256 aa7.83□□□□□ -1.16
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ADAM32Q8TC27 787 aa7.83□□□□□ -1.16
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CSRNP1Q96S65 589 aa7.83□□□□□ -1.16
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
RNU6-1334P-201ENST00000516032 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.83□□□□□ -1.16
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CFAP69A5D8W1 941 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU6-1334P-201ENST00000516032 M0R2N6 131 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NPHP1O15259 732 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ATF3P18847 181 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP7.82□□□□□ -1.16
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SQSTM1Q13501 440 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MYBPC2Q14324 1141 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms