RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487620.1

ZNF3-215, Transcript of zinc finger protein 3, human

TSL 2

Gene ZNF3, Length 2,660 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF3-215	ENST00000487620	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ZNF3-215	ENST00000487620	ANXA1	P04083	346 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ZNF3-215	ENST00000487620	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ZNF3-215	ENST00000487620	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ZNF3-215	ENST00000487620	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ZNF3-215	ENST00000487620	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ZNF3-215	ENST00000487620	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ZNF3-215	ENST00000487620	PTPRU	Q92729	1446 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ZNF3-215	ENST00000487620	KDM4A	O75164	1064 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ZNF3-215	ENST00000487620	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ZNF3-215	ENST00000487620	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ZNF3-215	ENST00000487620	TSC1	Q92574	1164 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ZNF3-215	ENST00000487620	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ZNF3-215	ENST00000487620	HYPK	Q9NX55	129 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ZNF3-215	ENST00000487620	PTH1R	Q03431	593 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ZNF3-215	ENST00000487620	C14orf37	Q86TY3	774 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ZNF3-215	ENST00000487620	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ZNF3-215	ENST00000487620	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		11.71	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		11.71	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		11.71	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		11.71	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		11.71	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	BEND3	Q5T5X7	828 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	MTMR6	Q9Y217	621 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	KCNJ4	P48050	445 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	ABTB2	Q8N961	1025 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	NECAB1	Q8N987	351 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	SPC24	Q8NBT2	197 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	VPS53	Q5VIR6	699 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	LGR6	Q9HBX8	967 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	NWD1	Q149M9	1564 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	FAM177B	A6PVY3	158 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	AP5Z1	O43299	807 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	EID1	Q9Y6B2	187 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	DIP2A	Q14689	1571 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	KCNQ3	O43525	872 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	ME3	Q16798	604 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	FERMT3	Q86UX7	667 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	GPATCH3	Q96I76	525 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	CAMK4	Q16566	473 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	CCDC192	P0DO97	292 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	ST3GAL1	Q11201	340 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	AACS	Q86V21	672 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	ADCY9	O60503	1353 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	TEF	Q10587	303 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	FAM227B	Q96M60	508 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	KIF3A	Q9Y496	699 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	BTBD11	A6QL63	1104 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	KRT85	P78386	507 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	NECTIN1	Q15223	517 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	TTC6	Q86TZ1	520 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	EVI5L	Q96CN4	794 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
ZNF3-215	ENST00000487620	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	MAP3K11	Q16584	847 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	NBPF4	Q96M43	638 aa		11.64	□□□□□ -0.55

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