RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442396.6

ZNF839-202, Transcript of zinc finger protein 839, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene ZNF839, Length 2,987 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839-202ENST00000442396 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.23■■□□□ 1.15
ZNF839-202ENST00000442396 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.23■■□□□ 1.15
ZNF839-202ENST00000442396 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ZNF839-202ENST00000442396 NPHP1O15259 732 aa22.23■■□□□ 1.15
ZNF839-202ENST00000442396 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ZNF839-202ENST00000442396 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.23■■□□□ 1.15
ZNF839-202ENST00000442396 USP44Q9H0E7 712 aa22.23■■□□□ 1.15
ZNF839-202ENST00000442396 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.23■■□□□ 1.15
ZNF839-202ENST00000442396 CRB1P82279 1406 aa22.23■■□□□ 1.15
ZNF839-202ENST00000442396 ST3GAL1Q11201 340 aa22.22■■□□□ 1.15
ZNF839-202ENST00000442396 ALKQ9UM73 1620 aa22.22■■□□□ 1.15
ZNF839-202ENST00000442396 ARID5BQ14865 1188 aa22.22■■□□□ 1.15
ZNF839-202ENST00000442396 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.22■■□□□ 1.15
ZNF839-202ENST00000442396 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.22■■□□□ 1.15
ZNF839-202ENST00000442396 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.21■■□□□ 1.15
ZNF839-202ENST00000442396 SLFN14P0C7P3 912 aa22.21■■□□□ 1.15
ZNF839-202ENST00000442396 CEP135Q66GS9 1140 aa22.21■■□□□ 1.15
ZNF839-202ENST00000442396 ERICH4A6NGS2 130 aa22.2■■□□□ 1.15
ZNF839-202ENST00000442396 MLECQ14165 292 aa22.2■■□□□ 1.15
ZNF839-202ENST00000442396 KIF18AQ8NI77 898 aa22.2■■□□□ 1.15
ZNF839-202ENST00000442396 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.2■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 USP27XA6NNY8 438 aa22.2■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 SRGAP3O43295 1099 aa22.2■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 KCNJ4P48050 445 aa22.2■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 ZNF165P49910 485 aa22.2■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa22.2■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.19■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.19■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 VGLL3A8MV65 326 aa22.19■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.19■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 BICD2Q8TD16 824 aa22.19■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 SPATA32Q96LK8 384 aa22.19■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 AOX1Q06278 1338 aa22.18■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.18■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.17■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 TMEM51Q9NW97 253 aa22.17■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 STK3Q13188 491 aa22.17■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.17■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 VPS53Q5VIR6 699 aa22.17■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.17■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 NR1I2O75469 434 aa22.17■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 SSH3Q8TE77 659 aa22.17■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 ST7Q9NRC1 585 aa22.17■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 SYCP1Q15431 976 aa22.16■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 TAF3Q5VWG9 929 aa22.16■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 RAB11FIP3O75154 756 aa22.16■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 KRT222Q8N1A0 295 aa22.16■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 TERF2Q15554 542 aa22.15■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.15■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.15■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 ELF2Q15723 593 aa22.14■■□□□ 1.14
ZNF839-202ENST00000442396 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.14■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 A0A087WWV3 80 aa22.14■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.14■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 PTPN14Q15678 1187 aa22.13■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.13■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 FBXW7Q969H0 707 aa22.13■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.12■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa22.12■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.12■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.12■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 USP16Q9Y5T5 823 aa22.12■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.11■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 SKILP12757 684 aa22.11■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 DDX11Q96FC9 970 aa22.11■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.1■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.09■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 PGBD1Q96JS3 809 aa22.09■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.09■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.09■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 ELP1O95163 1332 aa22.09■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.09■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.09■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ZNF839-202ENST00000442396 FAM227BQ96M60 508 aa22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms