RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 CNTROBQ8N137 903 aa18.89■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 ERBB3P21860 1342 aa18.89■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 LARGE1O95461 756 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 SASH1O94885 1247 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 IGKV5-2P06315 115 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 ZNF445P59923 1031 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 ADCK5Q3MIX3 580 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 NLRP2Q9NX02 1062 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 SYCE3A1L190 88 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 ESPNB1AK53 854 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 AK2P54819 239 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 TCHHQ07283 1943 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 MTX1Q13505 466 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 AACSQ86V21 672 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 CLCN1P35523 988 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 EPHA10Q5JZY3 1008 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 RUFY3Q7L099 469 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 MCM2P49736 904 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 CHRNA2Q15822 529 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 IL17RAQ96F46 866 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 TTC14Q96N46 770 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 GRM8O00222 908 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 FAM227BQ96M60 508 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 ZNF790Q6PG37 636 aa18.85■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 C5P01031 1676 aa18.85■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 C1orf167Q5SNV9 1468 aa18.85■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa18.84■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 ALDH1L1O75891 902 aa18.84■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 CASTP20810 708 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP18.84■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 ECHDC1Q9NTX5 307 aa18.84■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 XAGE3Q8WTP9 111 aa18.84■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa18.84■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 USP16Q9Y5T5 823 aa18.84■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 MEGF6O75095 1541 aa18.83■□□□□ 0.61
NISCH-202ENST00000420808 RIC3Q7Z5B4 369 aa18.83■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 LINS1Q8NG48 757 aa18.83■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 HYPKQ9NX55 129 aa18.83■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa18.83■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 CHGBP05060 677 aa18.83■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa18.83■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 COPS6Q7L5N1 327 aa18.83■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 TAF6LQ9Y6J9 622 aa18.83■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 RNF214Q8ND24 703 aa18.82■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 MYD88Q99836 296 aa18.82■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 TTC41PQ6P2S7 1318 aa18.82■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa18.82■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa18.82■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 PPP1R9BQ96SB3 815 aa18.82■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 BOLA2Q9H3K6 86 aa18.82■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 SLC52A2Q9HAB3 445 aa18.82■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 NPHP3Q7Z494 1330 aa18.82■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 ADAMTSL3P82987 1691 aa18.81■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa18.81■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 PHKG2P15735 406 aa18.81■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 TCEANC2Q96MN5 208 aa18.81■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 CCDC173Q0VFZ6 552 aa18.8■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 USP48Q86UV5 1035 aa18.8■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 NEURL1BA8MQ27 555 aa18.8■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 ST3GAL1Q11201 340 aa18.8■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 CNPY2Q9Y2B0 182 aa18.8■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 CCDC83Q8IWF9 413 aa18.79■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 A0A0D9SFI3 127 aa18.79■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 CYP27B1O15528 508 aa18.79■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa18.79■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa18.78■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa18.78■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 LRSAM1Q6UWE0 723 aa18.78■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 UTYO14607 1347 aa18.78■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP18.78■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 LRP10Q7Z4F1 713 aa18.78■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 NECAB1Q8N987 351 aa18.78■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 C19orf44Q9H6X5 657 aa18.78■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa18.77■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 SYT1P21579 422 aa18.77■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 GCKRQ14397 625 aa18.77■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa18.77■□□□□ 0.6
NISCH-202ENST00000420808 DDX58O95786 925 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.59
NISCH-202ENST00000420808 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88 ms