RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.03■■□□□ 1.12
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PTPRC-206ENST00000413409 ZPR1O75312 459 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRC-206ENST00000413409 IL13P35225 146 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRC-206ENST00000413409 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRC-206ENST00000413409 ERFEQ4G0M1 354 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRC-206ENST00000413409 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRC-206ENST00000413409 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.01■■□□□ 1.11
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PTPRC-206ENST00000413409 CRBNQ96SW2 442 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRC-206ENST00000413409 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.01■■□□□ 1.11
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PTPRC-206ENST00000413409 H0YIN7 160 aa21.98■■□□□ 1.11
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PTPRC-206ENST00000413409 C21orf2O43822 256 aa21.97■■□□□ 1.11
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PTPRC-206ENST00000413409 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.94■■□□□ 1.1
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PTPRC-206ENST00000413409 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
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PTPRC-206ENST00000413409 LTBP3Q9NS15 1303 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRC-206ENST00000413409 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.91■■□□□ 1.1
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PTPRC-206ENST00000413409 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRC-206ENST00000413409 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.88■■□□□ 1.09
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PTPRC-206ENST00000413409 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
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PTPRC-206ENST00000413409 HMOX1P09601 288 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRC-206ENST00000413409 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.85■■□□□ 1.09
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PTPRC-206ENST00000413409 SLC39A6Q13433 755 aa21.83■■□□□ 1.09
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PTPRC-206ENST00000413409 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.82■■□□□ 1.08
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PTPRC-206ENST00000413409 EPHX2P34913 555 aa21.8■■□□□ 1.08
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PTPRC-206ENST00000413409 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PTPRC-206ENST00000413409 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRC-206ENST00000413409 IFT57Q9NWB7 429 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRC-206ENST00000413409 HACL1Q9UJ83 578 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRC-206ENST00000413409 TSKSQ9UJT2 592 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRC-206ENST00000413409 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PTPRC-206ENST00000413409 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa21.8■■□□□ 1.08
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