RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 ERBB4Q15303 1308 aa19.81■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 NASPP49321 788 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 SUCLG2Q96I99 432 aa19.81■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 ERBB3P21860 1342 aa19.81■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 PDIA6Q15084 440 aa19.8■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF445P59923 1031 aa19.8■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 PRDM4Q9UKN5 801 aa19.8■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 NLRP2Q9NX02 1062 aa19.79■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 HYPKQ9NX55 129 aa19.79■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 ADAMTSL3P82987 1691 aa19.79■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 CPA1P15085 419 aa19.79■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 GRM8O00222 908 aa19.78■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 MYL6BP14649 208 aa19.78■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa19.78■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP19.78■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 C1orf167Q5SNV9 1468 aa19.78■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 TTC41PQ6P2S7 1318 aa19.78■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa19.78■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 LINS1Q8NG48 757 aa19.78■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM63CQ9P1W3 806 aa19.78■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa19.78■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 AACSQ86V21 672 aa19.77■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 ECHDC1Q9NTX5 307 aa19.77■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF790Q6PG37 636 aa19.77■□□□□ 0.76
SHQ1-201ENST00000325599 DTNBO60941 627 aa19.77■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 IGKV5-2P06315 115 aa19.77■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 PTH1RQ03431 593 aa19.77■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa19.77■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 CABLES1Q8TDN4 633 aa19.77■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa19.76■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 SASH1O94885 1247 aa19.76■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 KLHDC4Q8TBB5 520 aa19.76■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa19.76■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 RBSNQ9H1K0 784 aa19.76■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa19.76■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 SIL1Q9H173 461 aa19.76■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 TCHHQ07283 1943 aa19.75■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 ESPNB1AK53 854 aa19.75■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 AK2P54819 239 aa19.75■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 RIC3Q7Z5B4 369 aa19.75■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 TTC14Q96N46 770 aa19.75■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 C19orf44Q9H6X5 657 aa19.75■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 GDPD2Q9HCC8 539 aa19.75■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa19.75■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 SLC52A2Q9HAB3 445 aa19.74■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 NPHP3Q7Z494 1330 aa19.74■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 DDX58O95786 925 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 SYCE3A1L190 88 aa19.73■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 RUFY3Q7L099 469 aa19.73■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 XAGE3Q8WTP9 111 aa19.73■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 PDCL3Q9H2J4 239 aa19.73■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 C5P01031 1676 aa19.73■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 PHKG2P15735 406 aa19.73■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 CHRNA2Q15822 529 aa19.73■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 ADCK5Q3MIX3 580 aa19.73■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 COPS6Q7L5N1 327 aa19.73■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 ERC1Q8IUD2 1116 aa19.73■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 UTYO14607 1347 aa19.72■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 CASTP20810 708 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa19.72■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP19.72■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 EPHA10Q5JZY3 1008 aa19.72■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 PPP1R9BQ96SB3 815 aa19.72■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 USP16Q9Y5T5 823 aa19.72■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC173Q0VFZ6 552 aa19.71■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 FAM227BQ96M60 508 aa19.71■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 LARGE1O95461 756 aa19.71■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa19.71■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 GPATCH3Q96I76 525 aa19.71■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 MYD88Q99836 296 aa19.71■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 MEGF6O75095 1541 aa19.71■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
SHQ1-201ENST00000325599 NEURL1BA8MQ27 555 aa19.7■□□□□ 0.74
SHQ1-201ENST00000325599 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
SHQ1-201ENST00000325599 TATP17735 454 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
SHQ1-201ENST00000325599 SCN11AQ9UI33 1791 aa19.7■□□□□ 0.74
SHQ1-201ENST00000325599 ALS2Q96Q42 1657 aa19.7■□□□□ 0.74
SHQ1-201ENST00000325599 HDAC5Q9UQL6 1122 aa19.7■□□□□ 0.74
SHQ1-201ENST00000325599 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.2 ms