RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vamp4O70480 141 aa29.19■■■□□ 2.26
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm16440K7N6G6 218 aa29.05■■■□□ 2.24
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm2244L7N2A3 218 aa29.05■■■□□ 2.24
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm8271L7N2E2 218 aa29.05■■■□□ 2.24
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa29.01■■■□□ 2.23
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atp6v0a2P15920 856 aa29.01■■■□□ 2.23
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Soga3Q6NZL0 945 aa28.96■■■□□ 2.23
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa28.96■■■□□ 2.23
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa28.96■■■□□ 2.23
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CanxP35564 591 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dok7Q18PE0 504 aa28.94■■■□□ 2.22
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Igflr1Q3U4N7 345 aa28.94■■■□□ 2.22
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Myh1Q5SX40 1942 aa28.92■■■□□ 2.22
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