RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000002112.14

Trappc6a-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6a, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Kank1E9Q238 1360 aa22.76■■□□□ 1.23
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Gas2l2Q5SSG4 860 aa22.75■■□□□ 1.23
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ciapin1Q8WTY4 309 aa22.75■■□□□ 1.23
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Dbndd1Q9CZ00 160 aa22.75■■□□□ 1.23
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Kif13bA0A286YCV9 1847 aa22.74■■□□□ 1.23
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Hspa2P17156 633 aa22.74■■□□□ 1.23
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Chl1P70232 1209 aa22.74■■□□□ 1.23
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Fam83gQ5SWY7 812 aa22.74■■□□□ 1.23
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ccdc60Q8C4J0 545 aa22.74■■□□□ 1.23
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Polr3glQ8R0C0 218 aa22.74■■□□□ 1.23
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Duox1A2AQ92 1551 aa22.74■■□□□ 1.23
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Bicc1Q99MQ1 977 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Foxo3Q9WVH4 672 aa22.73■■□□□ 1.23
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa22.73■■□□□ 1.23
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa22.73■■□□□ 1.23
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ofd1Q80Z25 1017 aa22.72■■□□□ 1.23
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Susd4Q8BH32 490 aa22.72■■□□□ 1.23
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Flt4P35917 1363 aa22.72■■□□□ 1.23
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Itgb4A2A863 1818 aa22.71■■□□□ 1.23
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Nedd4P46935 887 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ddx58Q6Q899 926 aa22.7■■□□□ 1.22
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 AbraQ8BUZ1 375 aa22.7■■□□□ 1.22
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Eva1cP58659 440 aa22.69■■□□□ 1.22
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Gja5Q01231 358 aa22.69■■□□□ 1.22
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Aplp1Q03157 653 aa22.69■■□□□ 1.22
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Map3k2Q61083 619 aa22.69■■□□□ 1.22
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Myd88P22366 296 aa22.68■■□□□ 1.22
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Fkbp5Q64378 456 aa22.68■■□□□ 1.22
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Strip1Q8C079 837 aa22.68■■□□□ 1.22
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Cct4P80315 539 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 B4galnt4Q766D5 1034 aa22.67■■□□□ 1.22
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Pdzph1Q8BGR1 1238 aa22.67■■□□□ 1.22
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa22.67■■□□□ 1.22
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Casz1Q9CWL2 1761 aa22.66■■□□□ 1.22
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 MypnQ5DTJ9 1315 aa22.66■■□□□ 1.22
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 AK157302I3ITR1 129 aa22.66■■□□□ 1.22
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Cyp2d11P24457 504 aa22.66■■□□□ 1.22
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Isca1Q9D924 129 aa22.66■■□□□ 1.22
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Atp2b4Q6Q477 1205 aa22.65■■□□□ 1.22
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa22.65■■□□□ 1.22
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Stard3nlQ9DCI3 235 aa22.65■■□□□ 1.22
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ankrd31A0A140LI88 1765 aa22.65■■□□□ 1.22
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Exoc6bA6H5Z3 810 aa22.64■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Cyp2c68K7N6C2 491 aa22.64■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 EgfrQ01279 1210 aa22.64■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Tmco5bQ80X59 307 aa22.64■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Cd248Q91V98 765 aa22.64■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Cwc25Q9DBF7 416 aa22.64■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Mrc1Q61830 1456 aa22.64■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Col4a5Q63ZW6 1691 aa22.64■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Disp3A3KFU9 1347 aa22.63■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Arap2Q8BZ05 1703 aa22.63■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ank1Q02357 1862 aa22.63■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Spon1Q8VCC9 807 aa22.63■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa22.62■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Olfr247E9PVJ7 320 aa22.62■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 D830030K20RikE9PYQ5 218 aa22.62■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Gm3043K7N693 218 aa22.62■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Gm16440K7N6G6 218 aa22.62■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Olfr819K7N727 320 aa22.62■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Gm2244L7N2A3 218 aa22.62■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Gm3278L7N2D2 218 aa22.62■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Gm8271L7N2E2 218 aa22.62■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ppm1mQ8BU27 406 aa22.62■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 GptQ8QZR5 496 aa22.61■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ttc5Q99LG4 440 aa22.61■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Atp6v0a2P15920 856 aa22.6■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Nectin2P32507 530 aa22.6■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ptcd1Q8C2E4 695 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ehd4Q9EQP2 541 aa22.6■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Klrk1O54709 232 aa22.59■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Cops6O88545 324 aa22.59■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Fhdc1Q3ULZ2 1149 aa22.59■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ttc14Q9CSP9 761 aa22.59■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Fam213aQ9CYH2 218 aa22.59■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Foxo4Q9WVH3 505 aa22.59■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Myh1Q5SX40 1942 aa22.59■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Cyp19a1P28649 503 aa22.58■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 CanxP35564 591 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 HellsQ60848 821 aa22.58■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Cyp7a1Q64505 503 aa22.58■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Soga3Q6NZL0 945 aa22.58■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Atxn2lQ7TQH0 1049 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Aknad1E9Q8N6 675 aa22.57■■□□□ 1.2
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Spire2Q8K1S6 718 aa22.57■■□□□ 1.2
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Igflr1Q3U4N7 345 aa22.56■■□□□ 1.2
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Unc5clQ6R653 518 aa22.56■■□□□ 1.2
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Gm7347D3YYI9 267 aa22.55■■□□□ 1.2
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Speer4aF8VPX6 267 aa22.55■■□□□ 1.2
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ttc19Q8CC21 365 aa22.55■■□□□ 1.2
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 NogP97466 232 aa22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 1968.4 ms