RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1W2PR77 199 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC25A12O75746 678 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 FCGR3AP08637 254 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC00869P0C866 280 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTPN4P29074 926 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 G6PCP35575 357 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARHGDIAP52565 204 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARHGDIBP52566 201 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF85Q03923 595 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF154Q13106 437 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 FGD3Q5JSP0 725 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACP7Q6ZNF0 438 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q71RC1 249 aaPredicted RBP-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 TEX26Q8N6G2 289 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR2L3Q8NG85 312 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR4K1Q8NGD4 311 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 NUDCD1Q96RS6 583 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 RMDN3Q96TC7 470 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 PKMYT1Q99640 499 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 REEP2Q9BRK0 252 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 POLR3GLQ9BT43 218 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTGES2Q9H7Z7 377 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 DNAJC18Q9H819 358 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 VPS37BQ9H9H4 285 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 POLKQ9UBT6 870 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL36AQ9UHA7 158 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 FEM1BQ9UK73 627 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ETV7Q9Y603 341 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCPQ6ZWJ8 1503 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 FRMPD3Q5JV73 1810 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 A8MVM7 634 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 LGALS9O00182 355 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 TNFSF14O43557 240 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCGB1D2O95969 90 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 PDGFRBP09619 1106 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR2T7P0C7T2 308 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF688P0C7X2 276 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRLRP16471 622 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 GJA1P17302 382 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 HOXD10P28358 340 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 DUTP33316 252 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 RBBP4Q09028 425 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 LCP2Q13094 533 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF181Q2M3W8 571 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 CFAP77Q6ZQR2 320 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 COX15Q7KZN9 410 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 NDUFAF2Q8N183 169 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 GVQW1Q8N7I0 195 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLEC1AQ8NC01 280 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCFD2Q8WU76 684 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 DRC1Q96MC2 740 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 GAD1Q99259 594 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 CNPY3Q9BT09 278 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF416Q9BWM5 594 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ITM2CQ9NQX7 267 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ONECUT1Q9UBC0 465 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLXNA3P51805 1871 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF320A2RRD8 509 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANKUB1A6NFN9 424 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 CASTOR2A6NHX0 329 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 GJE1A6NN92 205 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANGPTL7O43827 346 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 AHCYL1O43865 530 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 USO1O60763 962 aaKnown RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 GABRA5P31644 462 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABCD1P33897 745 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPM1AP35813 382 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLDN15P56746 228 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 BACE1P56817 501 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 IHHQ14623 411 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANKRD1Q15327 319 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 NFIL3Q16649 462 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 TIGD6Q17RP2 521 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 PIGGQ5H8A4 983 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR2B11Q5JQS5 317 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 SHEQ5VZ18 495 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM225Q6GV28 225 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 GIMAP6Q6P9H5 292 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 CXCL17Q6UXB2 119 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 BATF2Q8N1L9 274 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ALLCQ8N6M5 410 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM104Q8NE00 496 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR10S1Q8NGN2 331 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD99L2Q8TCZ2 262 aa-1.68□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.3 ms