RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMC6Q96SB8 1091 aa24.2■■□□□ 1.46
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR14I1A6ND48 311 aa24.19■■□□□ 1.46
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PROM1O43490 865 aa24.19■■□□□ 1.46
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHG3P01860 377 aa24.19■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TYK2P29597 1187 aa24.19■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHBP35232 272 aa24.19■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAGEA5P43359 124 aa24.19■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIK3CGP48736 1102 aa24.19■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SERPINB8P50452 374 aa24.19■■□□□ 1.46
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa24.19■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR5M3Q8NGP4 307 aa24.19■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LILRB4Q8NHJ6 448 aa24.19■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PNPLA3Q9NST1 481 aa24.19■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LIPGQ9Y5X9 500 aa24.19■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EML6Q6ZMW3 1958 aa24.19■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCKDKO14874 412 aa24.18■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR10H2O60403 315 aa24.18■■□□□ 1.46
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR75O95800 540 aa24.18■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PMPCAQ10713 525 aa24.18■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXO1Q12778 655 aa24.18■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CUL3Q13618 768 aa24.18■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HYAL4Q2M3T9 481 aa24.18■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP20A1Q6UW02 462 aa24.18■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRILQ7L0X0 811 aa24.18■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC15A4Q8N697 577 aa24.18■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR5M9Q8NGP3 310 aa24.18■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR78Q96P69 363 aa24.18■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC1Q9BTT6 524 aa24.18■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNPPD1Q9BV87 410 aa24.18■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VPS11Q9H270 941 aa24.18■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF11Q9Y3C5 154 aa24.18■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASB4Q9Y574 426 aa24.18■■□□□ 1.46
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM58BPP0C7Q3 252 aa24.17■■□□□ 1.46
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BSGP35613 385 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUP107P57740 925 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HERVK_113P63132 956 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERVK-8P63133 956 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC22A10Q63ZE4 541 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC29A4Q7RTT9 530 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 L3MBTL4Q8NA19 623 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DOK4Q8TEW6 326 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERVK-6Q9BXR3 956 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR41Q9HAD4 459 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSD3Q9NYI0 1048 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERVK-19Q9WJR5 959 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1B0GVC2 190 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1W2PR48 441 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLOD5A6NK44 160 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM90A27PA6NNH2 459 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMPRSS11DO60235 418 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP6AP2O75787 350 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NADKO95544 446 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACVR2AP27037 513 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIGAP37287 484 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEK2P51955 445 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TLE4Q04727 773 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC10A1Q14973 349 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPRED3Q2MJR0 410 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF585AQ6P3V2 769 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF111Q6ZNA4 994 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR20Q8TBZ3 569 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIT1Q92963 219 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GAL3ST4Q96RP7 486 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UCK2Q9BZX2 261 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACSS3Q9H6R3 686 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNJ16Q9NPI9 418 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NINJ2Q9NZG7 142 aa24.16■■□□□ 1.46
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