RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF721Q8TF20 911 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SGCZQ96LD1 299 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM173AQ9BQD7 235 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTTY12Q9BZ98 90 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DMRT3Q9NQL9 472 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHF11Q9UIL8 331 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC189A1A4V9 331 aa24.24■■□□□ 1.47
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BIKQ13323 160 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PFKFB4Q16877 469 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LIPJQ5W064 366 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR180Q86V85 440 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MARVELD2Q8N4S9 558 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TANKQ92844 425 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACTR8Q9H981 624 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNX15Q9NRS6 342 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SACM1LQ9NTJ5 587 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSMD2Q7Z408 3487 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLPP1O14494 284 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLSO94925 669 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHEXP78562 749 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACAP2Q15057 778 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MPEG1Q2M385 716 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM47EQ6ZV65 393 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASB5Q8WWX0 329 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ESYT3A0FGR9 886 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 P04436 131 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARFIP1P53367 373 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPS13P62277 151 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLIN5Q00G26 463 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC7A5Q01650 507 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNFRSF17Q02223 184 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOLH1Q04609 750 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASPHQ12797 758 aa24.22■■□□□ 1.47
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIGGQ5H8A4 983 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EMC4Q5J8M3 183 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C18orf63Q68DL7 685 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLC3Q6P597 504 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUBPLQ8TB37 319 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 REPS1Q96D71 796 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ART5Q96L15 291 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ENKD1Q9H0I2 346 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL1RL2Q9HB29 575 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATG4BQ9Y4P1 393 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF407Q9C0G0 2248 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A096LPK6 155 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HMX2A2RU54 273 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPIPA2E9PIF3 369 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPIPA3F8WFD2 350 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHL2O95198 593 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGKV3-11P04433 115 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM109AQ8N4B1 249 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM251Q8N6I4 163 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RND1Q92730 232 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXL20Q96IG2 436 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF6Q9Y252 685 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLQO75417 2590 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC14BA6NHZ5 514 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H0YIV9 168 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLK8O60259 260 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UGDHO60701 494 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCL3P10147 92 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHRNB4P30926 498 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNASE1L1P49184 302 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GTF2H2Q13888 395 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C8orf74Q6P047 294 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C9orf40Q8IXQ3 194 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPRMLQ8N4K4 120 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACBD4Q8NC06 268 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC22A8Q8TCC7 542 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHTF18Q8WVB6 975 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C14orf79Q96F83 325 aa24.2■■□□□ 1.46
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