RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 J3QKU1 62 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 NPHS1O60500 1241 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 GPR75O95800 540 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 F10P00742 488 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 CHRNGP07510 517 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 UROSP10746 265 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 ARRB2P32121 409 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 ST13P50502 369 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 MAPK12P53778 367 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 ARG2P78540 354 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 MPP2Q14168 576 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 CLEC6AQ6EIG7 209 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 TRIM46Q7Z4K8 759 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 MMP21Q8N119 569 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 BEST3Q8N1M1 668 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 SLC5A8Q8N695 610 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 NCLNQ969V3 563 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 TM4SF18Q96CE8 201 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 RNF32Q9H0A6 362 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 CDCP1Q9H5V8 836 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 TEKT2Q9UIF3 430 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 ACTL7BQ9Y614 415 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 A0A1W2PS29 197 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 DYTNA2CJ06 578 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 C17orf105B2RV13 164 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 DDAH2O95865 285 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 STT3AP46977 705 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 TNFSF10P50591 281 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 CLCN2P51788 898 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 TAS2R50P59544 299 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 BIKQ13323 160 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 IGFBP7Q16270 282 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 MEP1AQ16819 746 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 CES4AQ5XG92 561 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 ARMC10Q8N2F6 343 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 ZNF321PQ8N8H1 164 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 MORN4Q8NDC4 146 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 OR14A16Q8NHC5 309 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 VMP1Q96GC9 406 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 DGAT2Q96PD7 388 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 WDR41Q9HAD4 459 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 MCM8Q9UJA3 840 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 CES1P1Q9UKY3 287 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 CCL27Q9Y4X3 112 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 OR5H15A6NDH6 313 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 AZIN1O14977 448 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 CRCPO75575 148 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 DHRS4L1P0CG22 281 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 TNNI3P19429 210 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 SERPINB4P48594 390 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 FOXK1P85037 733 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 BTKQ06187 659 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ACSM2AQ08AH3 577 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 TLR1Q15399 786 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 SPIN4Q56A73 249 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 KANK2Q63ZY3 851 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ACSM2BQ68CK6 577 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 GALNT18Q6P9A2 607 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 LGI4Q8N135 537 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 C7orf57Q8NEG2 295 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 OR1N1Q8NGS0 311 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 CPT1CQ8TCG5 803 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 SLC2A12Q8TD20 617 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 MIB2Q96AX9 1013 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 PKNOX2Q96KN3 472 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 DEFB126Q9BYW3 111 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 TUBB1Q9H4B7 451 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 SIRT5Q9NXA8 310 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 TMEM200CA6NKL6 621 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 GABRR3A8MPY1 467 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 TMEM233B4DJY2 109 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 HRKO00198 91 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 TM9SF1O15321 606 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 PCDH7O60245 1069 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 GUCY1B2O75343 617 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms