RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 DCSTAMPQ9H295 470 aa16.33■□□□□ 0.21
NISCH-213ENST00000489895 PGAP2Q9UHJ9 254 aa16.33■□□□□ 0.21
NISCH-213ENST00000489895 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa16.33■□□□□ 0.21
NISCH-213ENST00000489895 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.21
NISCH-213ENST00000489895 SOCS7O14512 581 aa16.33■□□□□ 0.21
NISCH-213ENST00000489895 DBIP07108 87 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
NISCH-213ENST00000489895 UGT3A2Q3SY77 523 aa16.33■□□□□ 0.21
NISCH-213ENST00000489895 TUBA3EQ6PEY2 450 aa16.33■□□□□ 0.21
NISCH-213ENST00000489895 ACVR1CQ8NER5 493 aa16.33■□□□□ 0.21
NISCH-213ENST00000489895 NKD1Q969G9 470 aa16.33■□□□□ 0.21
NISCH-213ENST00000489895 BOCQ9BWV1 1114 aa16.33■□□□□ 0.21
NISCH-213ENST00000489895 OR51I1Q9H343 314 aa16.33■□□□□ 0.21
NISCH-213ENST00000489895 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.21
NISCH-213ENST00000489895 ABCB7O75027 752 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 PLCXD2Q0VAA5 305 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 LRIF1Q5T3J3 769 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 SLITRK4Q8IW52 837 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 OR52B6Q8NGF0 335 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 OR56A3Q8NH54 315 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 ACOT12Q8WYK0 555 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 ORAI3Q9BRQ5 295 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 SLC46A2Q9BY10 475 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 MAGIXQ9H6Y5 334 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 FZD3Q9NPG1 666 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 ASB6Q9NWX5 421 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 CH25HO95992 272 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 MT-ND5P03915 603 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 THEM6Q8WUY1 208 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 EHD1Q9H4M9 534 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 RDH14Q9HBH5 336 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 IGSF5Q9NSI5 407 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 C4AP0C0L4 1744 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 SH3PXD2BA1X283 911 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 CTC1Q2NKJ3 1217 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 C1orf216Q8TAB5 229 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 FANK1Q8TC84 345 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 SP140LQ9H930 580 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 ARNT2Q9HBZ2 717 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 FAM172BPA6NC97 362 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 HCRTR2O43614 444 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 INMTO95050 263 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 TMEM130Q8N3G9 435 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 B4GALT7Q9UBV7 327 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 METTL21EPA6NDL7 271 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 J3QLW9 94 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 HTR1AP08908 422 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 PEPDP12955 493 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 ZNF19P17023 458 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 GADD45AP24522 165 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 TAS1R1Q7RTX1 841 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 CCDC54Q8NEL0 328 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 SLC22A8Q8TCC7 542 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 APOOQ9BUR5 198 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 RBCK1Q9BYM8 510 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 MARCH7Q9H992 704 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 BRF2Q9HAW0 419 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 RNF13O43567 381 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 SLC15A3Q8IY34 581 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 FGF13Q92913 245 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 RELTQ969Z4 430 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 SYNGR4O95473 234 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 FGF4P08620 206 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 CD72P21854 359 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 ADAM17P78536 824 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 PMS2P3Q13401 168 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 ARFRP1Q13795 201 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 CD200R1Q8TD46 325 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 SCGB3A2Q96PL1 93 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 H0YJX3 145 aa16.31■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 DNAJB5O75953 348 aa16.31■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 RPP14O95059 124 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 SOX14O95416 240 aa16.31■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 PGCP20142 388 aa16.31■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 NUDT6P53370 316 aa16.31■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 TAS2R38P59533 333 aa16.31■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 SH3BP2P78314 561 aa16.31■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 CCINQ13939 588 aa16.31■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 SLC27A4Q6P1M0 643 aa16.31■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 OR52P1PQ8NH57 321 aa16.31■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 FAM129BQ96TA1 746 aa16.31■□□□□ 0.2
NISCH-213ENST00000489895 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.4 ms