RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 BSGP35613 385 aa17.21■□□□□ 0.35
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PTX4-201ENST00000293922 RAP1GDS1P52306 607 aa17.21■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 TGM3Q08188 693 aa17.21■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 TMEM198Q66K66 360 aa17.21■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 TRIM40Q6P9F5 258 aa17.21■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 TEX19Q8NA77 164 aa17.21■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 NUDT9Q9BW91 350 aa17.21■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 ADAM29Q9UKF5 820 aa17.21■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 SLC22A7Q9Y694 548 aa17.21■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 MAU2Q9Y6X3 613 aa17.21■□□□□ 0.35
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PTX4-201ENST00000293922 A6NL46 340 aa17.21■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 C4orf51C9J302 202 aa17.21■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 UBDO15205 165 aa17.21■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 ERI3O43414 337 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 PLA2G16P53816 162 aa17.21■□□□□ 0.34
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PTX4-201ENST00000293922 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.34
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PTX4-201ENST00000293922 TERF2Q15554 542 aa17.21■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 MUM1Q2TAK8 710 aa17.21■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 DCAF10Q5QP82 559 aa17.21■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 GARNL3Q5VVW2 1013 aa17.21■□□□□ 0.34
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PTX4-201ENST00000293922 C1orf50Q9BV19 199 aa17.21■□□□□ 0.34
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PTX4-201ENST00000293922 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.34
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 ALOX12P18054 663 aa17.2■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 MAPK1P28482 360 aa17.2■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP17.2■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 DIO3P55073 304 aa17.2■□□□□ 0.34
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PTX4-201ENST00000293922 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa17.2■□□□□ 0.34
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF385DQ9H6B1 395 aa17.2■□□□□ 0.34
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF304Q9HCX3 659 aa17.2■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 AIG1Q9NVV5 245 aa17.2■□□□□ 0.34
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PTX4-201ENST00000293922 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 MASP2O00187 686 aa17.19■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 PEX12O00623 359 aa17.19■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 PCDH7O60245 1069 aa17.19■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 CCDC22O60826 627 aa17.19■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 PRPS2P11908 318 aa17.19■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 BCKDHAP12694 445 aa17.19■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 IDO1P14902 403 aa17.19■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 PCSK2P16519 638 aa17.19■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 MMP11P24347 488 aa17.19■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 SSR2P43308 183 aa17.19■□□□□ 0.34
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PTX4-201ENST00000293922 FAM53BQ14153 422 aa17.19■□□□□ 0.34
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PTX4-201ENST00000293922 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 SAR1AQ9NR31 198 aa17.19■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 MRGBPQ9NV56 204 aa17.19■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 GPR83Q9NYM4 423 aa17.19■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa17.19■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa17.19■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 GPR45Q9Y5Y3 372 aa17.19■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 A0A0A6YYD5 115 aa17.18■□□□□ 0.34
PTX4-201ENST00000293922 EEDO75530 441 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
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