RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511467.1

PTPN13-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13, humanhuman

APPRIS P4 TSL 2 BASIC

Gene PTPN13, Length 8,076 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13-209ENST00000511467 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
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PTPN13-209ENST00000511467 PGCP20142 388 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPN13-209ENST00000511467 ATP12AP54707 1039 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPN13-209ENST00000511467 LPCAT3Q6P1A2 487 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPN13-209ENST00000511467 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPN13-209ENST00000511467 SNX33Q8WV41 574 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPN13-209ENST00000511467 ANXA2P2A6NMY6 339 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPN13-209ENST00000511467 NUDT19A8MXV4 375 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPN13-209ENST00000511467 TLE3Q04726 772 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPN13-209ENST00000511467 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
PTPN13-209ENST00000511467 HMGN3Q15651 99 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPN13-209ENST00000511467 GSTCDQ8NEC7 633 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPN13-209ENST00000511467 CPT1BQ92523 772 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPN13-209ENST00000511467 TBATAQ96M53 351 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPN13-209ENST00000511467 SYT3Q9BQG1 590 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPN13-209ENST00000511467 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPN13-209ENST00000511467 GLTPQ9NZD2 209 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPN13-209ENST00000511467 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPN13-209ENST00000511467 USP27XA6NNY8 438 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPN13-209ENST00000511467 GPRIN2O60269 458 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPN13-209ENST00000511467 ATP6AP2O75787 350 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPN13-209ENST00000511467 CNTN5O94779 1100 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPN13-209ENST00000511467 HLA-DQA2P01906 255 aa4.75□□□□□ -1.65
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