RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630868.1

CDRT1-208, CMT1A duplicated region transcript 1, human

BASIC

Gene CDRT1, Length 794 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDRT1-208	ENST00000630868	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	GPR17	Q13304	367 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	TRADD	Q15628	312 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	INA	Q16352	499 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	C18orf63	Q68DL7	685 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	KCTD11	Q693B1	232 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	CENPP	Q6IPU0	288 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	NEK5	Q6P3R8	708 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	KDELC1	Q6UW63	502 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	BTNL8	Q6UX41	500 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	RUFY3	Q7L099	469 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	APOLD1	Q96LR9	279 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	MTMR9	Q96QG7	549 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	ZNF559	Q9BR84	538 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	ACPT	Q9BZG2	426 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	CARD9	Q9H257	536 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	CDH20	Q9HBT6	801 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	STK36	Q9NRP7	1315 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	PTPN13	Q12923	2485 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868		A0A087WWV3	80 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868		A0A1W2PPW3	197 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	OR2M5	A3KFT3	312 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	MTMR11	A4FU01	709 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	RASGRF2	O14827	1237 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	NDUFS7	O75251	213 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	DIRAS3	O95661	229 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	GSR	P00390	522 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	MCF2	P10911	925 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	GPD1	P21695	349 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	GABRR2	P28476	465 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	HNMT	P50135	292 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	NUDT6	P53370	316 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	IRX4	P78413	519 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	GALK2	Q01415	458 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	CUL3	Q13618	768 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	RUNX3	Q13761	415 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	CEBPE	Q15744	281 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	MAPK11	Q15759	364 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	ZBTB6	Q15916	424 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	CALCRL	Q16602	461 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	RAB6C	Q53S08	254 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868		Q8N3U1	123 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	SLC5A8	Q8N695	610 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	CCNY	Q8ND76	341 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	DEFB124	Q8NES8	71 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CDRT1-208	ENST00000630868	FBXO30	Q8TB52	745 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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