RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNHIT1O43257 154 aa24.4■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZFAND5O76080 213 aa24.4■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GSTA2P09210 222 aa24.4■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPRP35270 261 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TFECO14948 347 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TFEBP19484 476 aa24.39■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD22P20273 847 aa24.39■■□□□ 1.49
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPX6P59796 221 aa24.39■■□□□ 1.49
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DOLPP1Q86YN1 238 aa24.39■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa24.39■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSF3RQ99062 836 aa24.39■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD244Q9BZW8 370 aa24.39■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASB1Q9Y576 335 aa24.39■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTNSO60931 367 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1QAP02745 245 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFNA16P05015 189 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTGER1P34995 402 aa24.38■■□□□ 1.49
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNC1P48547 511 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C2orf54Q08AI8 447 aa24.38■■□□□ 1.49
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BMPR2Q13873 1038 aa24.38■■□□□ 1.49
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa24.38■■□□□ 1.49
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHF12Q96QT6 1004 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ROGDIQ9GZN7 287 aa24.38■■□□□ 1.49
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRDM7Q9NQW5 492 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa24.38■■□□□ 1.49
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBN2P35556 2912 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLDN14O95500 239 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EPORP19235 508 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBCCQ15814 346 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAPH1Q70E73 1250 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GDF7Q7Z4P5 450 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MDGA2Q7Z553 956 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FGD2Q7Z6J4 655 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPM1NQ8N819 430 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STAG3L4Q8TBR4 150 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALG9Q9H6U8 611 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERVK-11Q9UQG0 969 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 E9PLN8 166 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GMPRP36959 345 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CASP2P42575 452 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MSH2P43246 934 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLTPP55058 493 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAV1Q03135 178 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STX4Q12846 297 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLMAPQ14BN4 828 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C3P1Q6ZMU1 363 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC25Q86WR0 208 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EID3Q8N140 333 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C16orf52Q8NHV5 167 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBE2E3Q969T4 207 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VKORC1Q9BQB6 163 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBCDQ9BTW9 1192 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MS4A8Q9BY19 250 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHACTR1Q9C0D0 580 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LYRM4Q9HD34 91 aa24.36■■□□□ 1.49
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