RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 DEPDC1Q5TB30 811 aa28.74■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 FCRLBQ6BAA4 426 aa28.74■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 ZNF595Q8IYB9 648 aa28.74■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 TMEM151AQ8N4L1 468 aa28.74■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 ACOT4Q8N9L9 421 aa28.74■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 GALNT11Q8NCW6 608 aa28.74■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP28.74■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 ZBTB26Q9HCK0 441 aa28.74■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 LYRM4Q9HD34 91 aa28.74■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
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INO80B-201ENST00000233331 TAC1P20366 129 aa28.73■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 TSFMP43897 325 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 CLNKQ7Z7G1 428 aa28.73■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 LCA5Q86VQ0 697 aa28.73■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 CNPY4Q8N129 248 aa28.73■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 ACMSDQ8TDX5 336 aa28.73■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 MZB1Q8WU39 189 aa28.73■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 HAS2Q92819 552 aa28.73■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa28.73■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 SLC29A3Q9BZD2 475 aa28.73■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 ASF1BQ9NVP2 202 aa28.73■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 STMN3Q9NZ72 180 aa28.73■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 CYR61O00622 381 aa28.72■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 SCELO95171 688 aa28.72■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 PYGBP11216 843 aa28.72■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 UQCRFS1P47985 274 aa28.72■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 TAS2R50P59544 299 aa28.72■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 TRAF3Q13114 568 aa28.72■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 OR1N1Q8NGS0 311 aa28.72■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 WDR20Q8TBZ3 569 aa28.72■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 RGMAQ96B86 450 aa28.72■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 ZNF354BQ96LW1 612 aa28.72■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 NTMT1Q9BV86 223 aa28.72■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 RNF32Q9H0A6 362 aa28.72■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP28.72■■■□□ 2.195e-8■■■■□ 25.5
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INO80B-201ENST00000233331 KCMF1Q9P0J7 381 aa28.72■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 SPACA6W5XKT8 324 aa28.72■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 SMIM23A6NLE4 172 aa28.71■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 TGFBR3LH3BV60 316 aa28.71■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 GNLYP22749 145 aa28.71■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 SLCO1A2P46721 670 aa28.71■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 TNFSF10P50591 281 aa28.71■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 NEK2P51955 445 aa28.71■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 ACER2Q5QJU3 275 aa28.71■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 OR4C11Q6IEV9 310 aa28.71■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 H3F3CQ6NXT2 135 aa28.71■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 CRLF3Q8IUI8 442 aa28.71■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 KIF2BQ8N4N8 673 aa28.71■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 FBXW2Q9UKT8 454 aa28.71■■■□□ 2.19
INO80B-201ENST00000233331 TRAV17A0A0B4J275 112 aa28.7■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 BEST3Q8N1M1 668 aa28.7■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 SLC5A8Q8N695 610 aa28.7■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 ELP5Q8TE02 316 aa28.7■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 ABI3Q9P2A4 366 aa28.7■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 NTNG1Q9Y2I2 539 aa28.7■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 CLDN16Q9Y5I7 305 aa28.7■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 OR5H15A6NDH6 313 aa28.69■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 PLPP1O14494 284 aa28.69■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 MYO1DO94832 1006 aa28.69■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 TSPAN8P19075 237 aa28.69■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 PPP2R1BP30154 601 aa28.69■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 CDH13P55290 713 aa28.69■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 VSNL1P62760 191 aa28.69■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 MEP1AQ16819 746 aa28.69■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 MILR1Q7Z6M3 343 aa28.69■■■□□ 2.18
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INO80B-201ENST00000233331 OR4F6Q8NGB9 312 aa28.69■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 NPAS2Q99743 824 aa28.69■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa28.69■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 PPCSQ9HAB8 311 aa28.69■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 A0A1W2PPM1 405 aa28.68■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 CTNSO60931 367 aa28.68■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 ETHE1O95571 254 aa28.68■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 GSTA1P08263 222 aa28.68■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 CPN2P22792 545 aa28.68■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 SLAMF1Q13291 335 aa28.68■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 FOXO6A8MYZ6 492 aa28.67■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 TCP11X1B4DZS4 312 aa28.67■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 MAN1A2O60476 641 aa28.67■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 DLX3O60479 287 aa28.67■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 SLU7O95391 586 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 OTCP00480 354 aa28.67■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 KRT15P19012 456 aa28.67■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 HERVK_113P63132 956 aa28.67■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 IFT88Q13099 833 aa28.67■■■□□ 2.18
INO80B-201ENST00000233331 CUL3Q13618 768 aa28.67■■■□□ 2.18
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