RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557021.5

UBE2V1-222, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 V1, human

TSL 5 BASIC

Gene UBE2V1, Length 2,258 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2V1-222	ENST00000557021	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	CHST10	O43529	356 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	RAD1	O60671	282 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	LRAT	O95237	230 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	PTGER1	P34995	402 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	HK2	P52789	917 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	ARSF	P54793	590 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	MC1R	Q01726	317 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	ID2	Q02363	134 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	HERC3	Q15034	1050 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	CGB2	Q6NT52	195 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	NKD1	Q969G9	470 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	SMIM10	Q96HG1	83 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021		A0A0G2JND7	137 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021		A0A1W2PS29	197 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021		C9JVG2	144 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	TXNDC9	O14530	226 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	ZNF195	O14628	629 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	DLGAP3	O95886	979 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	AVPR1B	P47901	424 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	BTG2	P78543	158 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	CT55	Q8WUE5	264 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	C7orf26	Q96N11	449 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	SERPINI1	Q99574	410 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	CENPK	Q9BS16	269 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	URAD	A6NGE7	173 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	HDAC3	O15379	428 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	RGS14	O43566	566 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	DLST	P36957	453 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	DIO3	P55073	304 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	NAA20	P61599	178 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	CUL3	Q13618	768 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	FAM53B	Q14153	422 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	TSSK3	Q96PN8	268 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	ZPBP	Q9BS86	351 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	BRF2	Q9HAW0	419 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021		E9PBE3	544 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	KLK10	O43240	276 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	B3GALT2	O43825	422 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	PCDH7	O60245	1069 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	KLHL41	O60662	606 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	LDB3	O75112	727 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	LSP1	P33241	339 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	ALDH9A1	P49189	494 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	MTTP	P55157	894 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	LIM2	P55344	173 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	PTGR1	Q14914	329 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	CA13	Q8N1Q1	262 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	METTL4	Q8N3J2	472 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	GATA6	Q92908	595 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	QRFPR	Q96P65	431 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	RAX	Q9Y2V3	346 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	ITPR1	Q14643	2758 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	SDHD	O14521	159 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-222	ENST00000557021	AKAP10	O43572	662 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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