RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM187AA6NFU0 413 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLDN4O14493 209 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP24.45■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STMN1P16949 149 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMSP52788 366 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLA2G16P53816 162 aa24.45■■□□□ 1.5
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GHDCQ8N2G8 530 aa24.45■■□□□ 1.5
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2L5Q8NG80 312 aa24.45■■□□□ 1.5
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABOP16442 354 aa24.44■■□□□ 1.5
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR4D1Q15615 310 aa24.44■■□□□ 1.5
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXO48Q5FWF7 155 aa24.44■■□□□ 1.5
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAATS1Q7Z4T9 603 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VN1R5Q7Z5H4 357 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF595Q8IYB9 648 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM47BQ8NA70 645 aa24.44■■□□□ 1.5
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD274Q9NZQ7 290 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXW2Q9UKT8 454 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FANCGO15287 622 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AGAP20933 346 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GP5P40197 560 aa24.43■■□□□ 1.5
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNFT1Q5M7Z0 435 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POGLUT1Q8NBL1 392 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM52Q8NDY8 209 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ESAMQ96AP7 390 aa24.43■■□□□ 1.5
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MEMO1Q9Y316 297 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCNX1Q96RV3 2341 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM159BA6NKW6 160 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TGFBR3LH3BV60 316 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRAMEF4O60810 478 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP2R1BP30154 601 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTTPP55157 894 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSF1Q00613 529 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DOC2AQ14183 400 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDK4Q16654 411 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADNP2Q6IQ32 1131 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABHD17CQ6PCB6 329 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYS1Q717R9 158 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM156Q8N614 296 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCLNQ969V3 563 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR34Q96EX3 536 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EFCAB11Q9BUY7 163 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLDN16Q9Y5I7 305 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSMD1Q96PZ7 3565 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAD51CO43502 376 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITGA10O75578 1167 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 S100BP04271 92 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CERS1P27544 350 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MEOX1P50221 254 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LIM2P55344 173 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB10P61026 200 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TGM3Q08188 693 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RCN2Q14257 317 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTAGE3PQ8IX95 158 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDPRQ8NCN5 879 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATA4Q8NEY3 305 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA1191Q96A73 305 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBXN10Q96LJ8 280 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAP2Q9NPF8 381 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRHL1Q9NZI5 618 aa24.41■■□□□ 1.5
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