RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 CCDC153Q494R4 210 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 GGTA1PQ4G0N0 100 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 LETMD1Q6P1Q0 360 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ZYG11AQ6WRX3 759 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 MILR1Q7Z6M3 343 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 SLC22A9Q8IVM8 553 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 TRPC4APQ8TEL6 797 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 REPS1Q96D71 796 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 L3HYPDHQ96EM0 354 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 IMMP1LQ96LU5 166 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 KCNC2Q96PR1 638 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 TBCDQ9BTW9 1192 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 KCMF1Q9P0J7 381 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 CYR61O00622 381 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 SUV39H1O43463 412 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 SCELO95171 688 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ETHE1O95571 254 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 OTCP00480 354 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 CELA2AP08217 269 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 LIM2P55344 173 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 RAB38P57729 211 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 NSDHLQ15738 373 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 QSOX2Q6ZRP7 698 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ACOT4Q8N9L9 421 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 BANPQ8N9N5 519 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 TMEM52Q8NDY8 209 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 PPP4R1Q8TF05 950 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 PTCHD1Q96NR3 888 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ROGDIQ9GZN7 287 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 LHPPQ9H008 270 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 PRM3Q9NNZ6 103 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 NECTIN3Q9NQS3 549 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 RIC8BQ9NVN3 520 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 MKS1Q9NXB0 559 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 PSD3Q9NYI0 1048 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 DAPP1Q9UN19 280 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 PLPP1O14494 284 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 PRMT3O60678 531 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 OR4F21O95013 312 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 PRR35P0CG20 571 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 MYL2P10916 166 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 MAOAP21397 527 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 PHEXP78562 749 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 CUL3Q13618 768 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 COLEC12Q5KU26 742 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 FRG2Q64ET8 278 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 OR4C11Q6IEV9 310 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 KBTBD2Q8IY47 623 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 FAM47BQ8NA70 645 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 PSMF1Q92530 271 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 RGMAQ96B86 450 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 APOPT1Q96IL0 206 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 FRG2BQ96QU4 278 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 CSF3RQ99062 836 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 TUBB6Q9BUF5 446 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 GSTO2Q9H4Y5 243 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 PRDM9Q9NQV7 894 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 C5AR2Q9P296 337 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 PPT2Q9UMR5 302 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 CLDN16Q9Y5I7 305 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 COL6A6A6NMZ7 2263 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 TGFBR3LH3BV60 316 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 SERPINA7P05543 415 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 CPA3P15088 417 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 SSR2P43308 183 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 TSFMP43897 325 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 RAP1GDS1P52306 607 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 ARFIP1P53367 373 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 ZNF844Q08AG5 666 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 KLRB1Q12918 225 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 SFT2D3Q587I9 215 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms